[发明专利]染色体9p21区段和KIF6基因SNP检测液相芯片以及特异性引物有效

专利信息
申请号: 201010196841.6 申请日: 2010-06-08
公开(公告)号: CN102031286A 公开(公告)日: 2011-04-27
发明(设计)人: 许嘉森;秦会娟;余刚;曾涛 申请(专利权)人: 广州益善生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 代理人: 万志香;曾旻辉
地址: 510663 广东省广州市广州科*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开了一种染色体9p21区段SNP检测液相芯片和特异性引物,主要包括有:ASPE引物对,每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对SNP位点的特异性引物组成,所述特异性引物是:针对染色体9p21区段G22115503C SNP的SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.18、A22086055G SNP的SEQID NO.19和SEQ ID NO.20、A22114477G SNP的SEQ ID NO.21和SEQ ID NO.22、A22105026G SNP的SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.24、A22105959G SNP的SEQ ID NO.25和SEQ ID NO.26、和/或A22088619G SNP的SEQ ID NO.27和SEQ ID NO.28;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.14;分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球;扩增引物。本发明还公开了染色体9p21区段和KIF6基因SNP检测液相芯片。本发明所提供的检测方法与测序法的吻合率高达100%。所制备的KIF6基因和染色体9p21区段SNP检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比。
搜索关键词: 染色体 p21 区段 kif6 基因 snp 检测 芯片 以及 特异性 引物
【主权项】:
一种染色体9p21区段SNP检测液相芯片,其特征是,主要包括有:(A)针对染色体9p21区段的SNP位点设计的野生型和突变型的ASPE引物对,每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对SNP位点的特异性引物组成,所述特异性引物是:针对染色体9p21区段G22115503C SNP的SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.18、A22086055G SNP的SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.20、A22114477G SNP的SEQ ID NO.21和SEQ ID NO.22、A22105026G SNP的SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.24、A22105959G SNP的SEQ ID NO.25和SEQ ID NO.26、和/或A22088619G SNP的SEQ ID NO.27和SEQ ID NO.28;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.14;(B)分别包被有特异的anti‑tag序列的、具有不同颜色编码的微球,所述anti‑tag序列选自SEQID NO.29~SEQ ID NO.42中的序列,且所述anti‑tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对,且所述anti‑tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;(C)用于扩增具有G22115503C、A22086055G、A22114477G、A22105026G、A22105959G和/或A22088619G SNP位点的染色体9p21区段目标序列的扩增引物。
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