[发明专利]一种基因注释语义相似度的计算方法无效
申请号: | 200810040050.7 | 申请日: | 2008-07-01 |
公开(公告)号: | CN101359349A | 公开(公告)日: | 2009-02-04 |
发明(设计)人: | 吴飞珍;马文丽;王妹;陈启龙;郑文岭;姚文娟;施国明 | 申请(专利权)人: | 上海大学 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 上海上大专利事务所(普通合伙) | 代理人: | 何文欣 |
地址: | 200444*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明提供了一种基因注释语义相似度的计算方法。这种方法通过基因本体协会提供的基因本体关联文件,将基因与基因本体结点建立关联。然后先计算基因本体结点的语义相似度,最后根据基因本体结点语义相似度计算基因注释语义相似度。本发明的有益效果在于:可以自动地、大批量地计算基因注释语义相似度。 | ||
搜索关键词: | 一种 基因 注释 语义 相似 计算方法 | ||
【主权项】:
1.一种基因注释语义相似度的计算方法,其特征在于从基因本体gene ontology,GO网站http://www.geneontology.org下载基因关联文件和GO文件,根据基因关联文件将基因名称与GO结点之间建立关联;然后先计算GO结点的语义相似度,最后计算基因注释语义相似度。
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