[发明专利]一种基因注释语义相似度的计算方法无效

专利信息
申请号: 200810040050.7 申请日: 2008-07-01
公开(公告)号: CN101359349A 公开(公告)日: 2009-02-04
发明(设计)人: 吴飞珍;马文丽;王妹;陈启龙;郑文岭;姚文娟;施国明 申请(专利权)人: 上海大学
主分类号: G06F19/00 分类号: G06F19/00
代理公司: 上海上大专利事务所(普通合伙) 代理人: 何文欣
地址: 200444*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明提供了一种基因注释语义相似度的计算方法。这种方法通过基因本体协会提供的基因本体关联文件,将基因与基因本体结点建立关联。然后先计算基因本体结点的语义相似度,最后根据基因本体结点语义相似度计算基因注释语义相似度。本发明的有益效果在于:可以自动地、大批量地计算基因注释语义相似度。
搜索关键词: 一种 基因 注释 语义 相似 计算方法
【主权项】:
1.一种基因注释语义相似度的计算方法,其特征在于从基因本体gene ontology,GO网站http://www.geneontology.org下载基因关联文件和GO文件,根据基因关联文件将基因名称与GO结点之间建立关联;然后先计算GO结点的语义相似度,最后计算基因注释语义相似度。
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