[发明专利]通用型分子标记开发方法及所设计的禾本科通用型标记无效

专利信息
申请号: 200510060852.0 申请日: 2005-09-22
公开(公告)号: CN1769492A 公开(公告)日: 2006-05-10
发明(设计)人: 吴为人;卢泳全;汪旭升 申请(专利权)人: 浙江大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 杭州中成专利事务所有限公司 代理人: 唐银益
地址: 310027*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 发明公开了一种通用型分子标记的开发方法,包括利用已知物种的基因组序列数据,还包括以下步骤:1)在已知一个物种A的内含子长度多态性、即ILP的基础上,借助生物信息学方法,将ILP所在的物种A与物种B的cDNA测序数据进行比对,在物种B的全基因组范围内搜索与该物种A的ILP所在cDNA同源的cDNA物种B为物种A同科但不同属的物种;2)PCR引物设计:在多态内含子两侧外显子的保守序列上设计PCR引物,并通过电子PCR和实际PCR进行检验;从而开发出能够在与物种A同科不同种或同科不同属的物种内,通过PCR进行检测的通用型分子标记,即IACGM。利用本发明的开发方法,能设计出通用性好、特异性高、称为基于内含子长度多态性的扩增共有序列遗传标记。
搜索关键词: 通用型 分子 标记 开发 方法 设计 禾本科
【主权项】:
1、一种通用型分子标记的开发方法,包括利用已知物种的基因组序列数据,其特征是还包括以下步骤:1)在已知一个物种A的内含子长度多态性、即ILP的基础上,借助生物信息学方法,将所述ILP所在的物种A与物种B的cDNA测序数据进行比对,在物种B的全基因组范围内搜索与该物种A的ILP所在cDNA同源的cDNA;所述物种B为物种A同科但不同属的物种;2)PCR引物设计:在多态内含子两侧外显子的保守序列上设计PCR引物,并通过电子PCR和实际PCR进行检验;从而开发出能够在与物种A同科不同种或同科不同属的物种内,通过PCR进行检测的通用型分子标记,即IACGM。
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