本发明公开了一对特异识别大豆胰蛋白酶抑制因子的核酸适配体、检测该抑制因子的试剂盒及其应用,所述特异性识别大豆胰蛋白酶抑制因子的核酸适配体包括:核苷酸序列为SEQ ID NO.1的核酸适配体Aptamer1以及核苷酸序列为SEQ ID NO.2的核酸适配体Aptamer2。所述检测大豆胰蛋白酶抑制因子的试剂盒包括:一种结合有前述的核酸适配体Aptamer1和pH指示剂分子的纳米颗粒、修饰有前述核酸适配体Aptamer 2的器皿。上述核酸适配体Aptamer1和Aptamer2分别特异性识别大豆胰蛋白酶抑制因子的不同部位并与之结合,并形成特有的带有PH指示剂分子的夹心结构,从而实现大豆胰蛋白酶抑制因子的检测,这种试剂盒的操作简单,省去复杂的样品前处理和提纯,检测特异性和灵敏度高。