本发明涉及基于KASP技术用于水稻整个生育期耐冷基因分型的引物组合及应用,所述水稻耐冷基因包括OsLTPL59、LTG1、qLTG3‑1、COLD1、bZIP73、qPSR10、CTB4a和HAN1,所述引物组含有24条引物,其序列分别如SEQ ID NO:1‑24所示。利用本发明提供的引物组能够快速检测水稻种质中耐冷基因功能等位基因和不同基因有利单倍型的组合方式,检测结果准确可靠,操作简单,成本低。本发明方法能够实现水稻耐冷功能基因的检测,对于一些野生稻的优异耐冷基因的利用提供依据。同时也能实现水稻育种材料耐冷功能基因的检测,解决耐冷表型鉴定复杂、困难等问题,为提高水稻耐冷性提供科学指导。
本发明公开了野生稻的一个抗冻基因及其编码蛋白与应用。该基因可具有下述核苷酸序列之一:1)序列表中SEQ ID №:1的DNA序列;2)在高严谨条件下可与序列表中SEQ ID №:1限定的DNA序列杂交的核苷酸序列。该基因的编码蛋白可具有下述氨基酸残基序列之一:1)序列表中的SEQID №:2;2)将序列表中SEQ ID №:2的氨基酸残基序列经过一至十个氨基酸残基的取代、缺失或添加且具有调控植物抗冻性的蛋白质。本发明的抗冻基因将在培育抗冻性增强的植物(特别是水稻)中发挥重要的作用。