本发明属于分子生物学技术领域，公开了一种线纹尖塘鳢遗传性别相关的SNP分子标记及其应用，具体公开了与线纹尖塘鳢性别相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记的序列如SEQ ID NO:1所示，SNP位点位于SEQ ID NO:1所示序列自5’端起第401位，其碱基为G/A。本发明利用分子遗传学及分子生物学的方法获得线纹尖塘鳢性别相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记可用于线纹尖塘鳢性别鉴定以及辅助育种，不受线纹尖塘鳢的年龄、性别等限制，可以实现在早期幼鱼阶段就可以进行性别筛选的目的，通过该SNP分子标记分型结果，确定线纹尖塘鳢为ZW性别决定。
本发明公开了与草鱼果糖‑1,6‑二磷酸酶相关的5个SNPs标记及应用。所述SNPs标记分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5至少一种所示。本发明发现SEQ ID NO.1标记为CC基因型和/或SEQ ID NO.3标记为AA基因型和/或SEQ ID NO.5标记为AC基因型和/或SEQ ID NO.1标记为CT基因型、SEQ ID NO.3标记为AA基因型、SEQ ID NO.5标记为AA基因型的个体生长性状具有显著优势，利用该SNPs标记简单快速的鉴定快长且体型修长的草鱼，为草鱼分子标记辅助选择育种提供基础。
