本发明公开一种双重荧光染色液,该染色液中的主要成分由Sybr Green I和多甲藻黄素‑叶绿素‑蛋白质复合物组成;所述Sybr Green I和多甲藻黄素‑叶绿素‑蛋白质复合物的用量比为0.8‑1.2∶3.5‑5,以重量份计。该染色液中还包括有乙酸、乙酸钠、甲基绿和Proclin 300防腐剂。所述多甲藻黄素‑叶绿素‑蛋白质复合物是从甲藻植物中提取出来的。本发明采用双重荧光染色液进行样本检测,染色效果明显提升,成像误差减少45%。经检测,本发明双重荧光染色液的荧光时效大大延长,染色后的样本可储存至7天。本发明双重荧光染色液用于样本检测,可使得操作流程大大缩短,只需要涂片后滴加染色液盖上盖玻片后即可镜下观察,无需冲洗和复染步骤,大大提高了检测效率。