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[发明专利]冷冻电镜成像中的颗粒筛选方法、装置、设备及存储介质-CN202310283510.3在审
发明人：包承龙;祝健颖;张起;胡名旭;史作强 -专利权人：清华大学
申请日： 2023-03-22 - 公布日： 2023-07-14 - 主分类号： G16B15/00 文献下载
摘要：本申请涉及一种冷冻电镜成像中的颗粒筛选方法、装置、设备及存储介质，其中，方法包括：基于冷冻电镜三维重构中的划分策略，将蛋白质重构最终颗粒数据集划分为对半数据集；分别对每个对半数据集中所有颗粒进行三维重构，得到第一蛋白质密度图和第二蛋白质密度图，以对对应的对半数据集中所有颗粒进行筛选，得到满足预设条件的颗粒；对三维重构和颗粒筛选进行迭代，直至达到预设迭代次数，并得到不同轮次第一蛋白质密度图和第二蛋白质密度图与其分辨率，进而确定最终颗粒数据集的最佳筛选比例。由此，解决了现有颗粒筛选技术过于依赖人为制定的筛选准则，且筛选时间较长，筛选算法准确性较低，难以快速、有效的筛选出大量低信噪比的颗粒等问题。
冷冻成像中的颗粒筛选方法装置设备存储介质

[发明专利]冷冻电镜中的高分辨率密度图配准方法-CN202211138544.5有效
发明人：包承龙;樊箫;张起;胡名旭;史作强 -专利权人：清华大学
申请日： 2022-09-19 - 公布日： 2023-06-16 - 主分类号： G06V20/69 文献下载
摘要：本申请公开了一种冷冻电镜中的高分辨率密度图配准方法，包括：获取冷冻电镜的初始密度图和待配准密度图；对初始密度图与预先构建的配准神经网络的输出坐标进行双线性插值，得到第一密度图，并将待配准密度图与第一密度图之间的最优传输距离和配准神经网络中多个残差网络单元散度的约束作为优化目标进行优化，得到配准神经网络的最优参数；根据最优参数将配准神经网络的每个残差网络单元的输出坐标与初始密度图进行双线性插值，得到配准动画的中间帧，并根据初始密度图、中间帧和第一密度图生成待配准密度图的配准轨迹，得到满足预设高分辨率条件的配准结果，由此，可以获得更多蛋白质结构和功能信息。
冷冻中的高分辨率密度图配准方法

[发明专利]一种冷冻电镜三维重构中重构参数搜索方法和系统-CN201810267090.9有效
发明人：李雪明;胡名旭;沈渊;余洪坤;杨广文;顾凯 -专利权人：清华大学
申请日： 2018-03-28 - 公布日： 2020-09-15 - 主分类号： G06T3/00 文献下载
摘要：本发明提供一种冷冻电镜三维重构中重构参数搜索方法和系统，所述方法包括：构建高维参数空间，对每一张实验照片，通过蒙特卡洛模拟方法在所述参数空间中进行随机采样，计算实验照片在每个采样点上与给定模型的似然度；对似然度大于设定条件的采样点进行重采样，产生新的随机采样点，并计算相应的似然度；重复此重采样过程，直至所有采样点收敛至具有最大似然度的采样点附近；将收敛后的一系列采样点的统计分布参数作为对该实验照片的重构参数的一种统计描述，并用于重构生物大分子的三维电子密度图。能对每个生物大分子颗粒成像的离焦量参数进行单独地精确测定，能大幅提高生物大分子的三维重构分辨率。
一种冷冻三维重构中重构参数搜索方法系统