本发明涉及基因工程和生物发酵技术领域,具体公开了一种发酵生产1,2‑丁二醇的方法、重组微生物及其应用。本发明提供了一种重组微生物,所述重组微生物与出发菌株相比,表达羧酸还原酶CAR,以及表达醇脱氢酶yqhD,所述出发菌株能够生产苏氨酸并将苏氨酸转化为2‑羟基丁酸;所述羧酸还原酶CAR的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述醇脱氢酶yqhD的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示。本发明的重组微生物在摇瓶或者发酵罐中可以葡萄糖等有机碳源为底物进行发酵培养,可获得光学纯的L‑1,2‑丁二醇或者D‑1,2‑丁二醇,提供了一条生物法合成1,2‑丁二醇的新途径。