本发明公开了SgTPS5基因启动子及其应用。属于生物工程技术领域。该启动子能驱动目的基因在植物营养组织部位的表达,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,是SgTPS5基因的启动子。该启动子可应用于植物营养组织部位表达和生产次生代谢产物的基因工程中。与现有技术相比,本发明取得的有益效果为:该启动子可用于在植物营养组织部位中大量表达目的基因,而不会驱动基因在种子中表达,避免因在生殖器官大量生产异源代谢产物而影响植物繁殖,从而为准确大量的表达植物次生代谢产物提供有效的基因资源,可用于重要次生代谢产物的高效生产。