本发明公开了一种艾滋病毒的全长基因及应用，将该HIV阳性的PBMCs与健康人来源的PBMCs进行混合共培养，提取共培养细胞的总DNA，分两段分别扩增，使两个片段总长度覆盖全长的HIV基因，将扩增所得9000bp和1800bp的片段连接入载体，获得两个质粒TOPO-HIV9K和TOPO-HIV1.8K，将所获得的质粒均用PvuI和BspT104I双酶切，琼脂糖凝胶电泳回收TOPO-HIV9K质粒中酶切下来的11.2kb片段和TOPO-HIV1.8K质粒中酶切下来的2kb片段，将回收的片段连接后转化大肠杆菌Top10，获得了HIV-1全长基因的质粒TOPO/05CNHB-hp3克隆Top10/05CNHB-hp3，经测序显示所克隆的一种HIV全长基因，序列为SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列。此hiv-1全长克隆有利于开发各种诊断试剂盒及相关药物。该基因在制备治疗或预防艾滋病毒的药物检验中的应用，对于中国的艾滋病的预防与控制具有更好的针对性。
本发明涉及一株HIV病毒(艾滋病毒)的全基因组，它具有SEQ ID NO.5所示的核苷酸全序列，其中一些部分的核苷酸序列可应用于HIV的疫苗设计和作为重要的疫苗开发材料的应用。本发明提供的序列与公布的U71182、DQ007902、DQ007903、DQ007901和AY180905等5株序列同源性在91％－96％范围，本序列与其它B’亚型病毒基因组序列的差异部分为本专利的特征，该差异所产生的核酸以及氨基酸水平的功能变化将直接或间接的影响后续的药物和疫苗设计，依据本序列所开发的疫苗和治疗药物将可能对我国的艾滋病防控产生积极影响。
