本发明涉及一种甲状腺乳头状癌的LncRNA标志物及其应用,属于分子生物学技术领域。本发明发现了一种新的LncRNA标志物,即LncPTCaTS,其互补DNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。LncPTCaTS在甲状腺乳头状癌组织中的表达水平明显低于正常组织,其低表达水平与甲状腺乳头状癌患者的生存不良有关。通过实验发现,LncPTCaTS在体外可以抑制甲状腺乳头状癌细胞的迁移和侵袭,在体内也可以抑制甲状腺乳头状癌细胞的转移,表明LncPTCaTS可以成为甲状腺乳头状癌精准治疗的新靶点,也是潜在的预测甲状腺乳头状癌靶向治疗疗效的指标,是一种新的甲状腺乳头状癌分子生物学标志物。