本发明公开了一种用于检测KMT2A‑PTD融合基因的试剂盒、其方法和应用,所述试剂盒至少包含引物对和探针,所述引物对包含第一正向引物、第二正向引物和反向引物;其中,所述第一正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述第二正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,所述探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。本发明设计的引物对和探针适用于微滴式数字PCR系统,检测时将反应液乳化成微滴,每一个微滴置于不同的反应单元进行独立检测,对于浓度较低的样本更易检出,提高了检测的灵敏度,进一步提升了检测的精确度,具有自动化程度高、操作简单的优势,更适合用于临床上白血病患者体内KMT2A‑PTD融合基因的微量残留检测。