本发明公开了生物碱cyanogramide的生物合成基因簇及其应用。本发明的来源于放线菌A.cyanogriseus WH1‑2216‑6(保藏编号为:CCTCC NO:M 2009277)的cyanogramide生物合成基因簇,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第393~13440位的碱基序列所示,包含10个基因;其中的P450氧化酶基因cyaH,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第10626~11843位的碱基序列的反向互补序列,编码P450氧化酶CyaH,其能以Fdx、Fdr和NADPH为辅因子催化cyanogramide D通过骨架重排生成cyanogramide。本发明所提供的包含cyanogramide生物合成相关的所有基因和蛋白信息可以帮助人们理解cyanogramide家族天然产物的生物合成机制,为进一步遗传改造提供了材料和知识。本发明所提供的基因及其蛋白质也可以用来寻找和发现可用于医药、工业或农业的化合物或基因、蛋白。
本发明公开了一种环脂肽类化合物生物合成基因簇及其激活方法与应用。环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成基因簇,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第2972‑101763位核苷酸序列所示。本发明的环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成基因簇相关的所有基因和蛋白信息,可以帮助人们理解环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成机制,为进一步遗传改造提高了材料和知识。另外本发明为通过操控调控基因激活沉默基因簇的表达提供了依据,并丰富了天然产物生物合成基因簇库,为药物先导化合物的发现提供了实体。