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[发明专利]一种双核酸酶单细胞谱系示踪系统及其应用-CN202310910983.1在审
发明人： 彭广敦;廖远鑫;陈城 -专利权人：中国科学院广州生物医药与健康研究院
申请日： 2023-07-24 - 公布日： 2023-10-20 - 主分类号： C12N15/85 文献下载
摘要：本发明公开了一种双核酸酶单细胞谱系示踪系统及其应用，所述系统包括：双核酸酶表达载体、引导RNA表达载体和靶点表达载体；所述双核酸酶表达载体中含有由TetON启动子控制的第一Cas核酸酶的编码基因和由EF1α启动子控制的第二Cas核酸酶的编码基因，所述第二Cas核酸酶的编码基因后还融合有ERT元件基因。本发明通过使用双核酸酶，通过多西环素(Dox)和他莫昔芬(4‑OHT)的添加灵活地控制两套多变的DNA序列(Barcode)产生系统独立地进行示踪，可用于追踪两个重要的生物学过程，此外，两套Barcode产生系统可同时启动进行记录，可以互相验证谱系记录的准确性。
一种核酸酶单细胞谱系系统及其应用

[发明专利]空间组学测序方法-CN202111372033.5在审
发明人： 彭广敦;江伏青;瞿芳芳 -专利权人：生物岛实验室
申请日： 2020-09-29 - 公布日： 2022-02-25 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本公开实施例公开了一种空间组学测序方法，包括：预处理样品切片；将所述微流控芯片覆盖在样品切片上；向所述微流控芯片的进样孔分别加入包含不同barcode A的第一物质，与所述样品切片进行第一反应；使用缓冲液对所述样品切片进行洗涤；以预定角度旋转所述微流控芯片，使得所述第一物质流经的所述微流控芯片的微流体通道的方向与旋转后的所述微流体通道的方向形成所述交叉定位标识；向旋转后的所述微流控芯片的进样孔分别加入包含不同barcode B的第二物质，与所述样品切片进行第二反应；其中，所述第一物质、第二物质还包括Tn5；依序对所述样品切片进行细胞裂解、扩增及建库后，根据所述交叉定位标识进行基因测序。
空间组学测序方法

[发明专利]一种单细胞表观转录组学测序方法-CN202111372042.4在审
发明人： 彭广敦;江伏青;瞿芳芳 -专利权人：生物岛实验室
申请日： 2020-09-29 - 公布日： 2022-02-15 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本公开实施例公开了一种单细胞表观转录组学测序方法，其特征在于，包括：对样品进行预处理；向预处理后的样品中加入目标蛋白的配偶体，使所述目标蛋白的配偶体与所述目标蛋白相结合；将所述样品与包含barcode A的第一物质和包含barcode B的第二物质进行孵育反应，所述第一物质和第二物质还包括Tn5和目标蛋白配偶体结合物质，所述目标蛋白配偶体结合物质用于结合所述目标蛋白配偶体，所述Tn5打断所述样品的cDNA形成cDNA片段，同时在该cDNA片段上添加barcode A和barcode B，然后依序进行细胞裂解、cDNA扩增及建库测序。
一种单细胞表观转录组学测序方法

[发明专利]微流控芯片、用于空间组学测序及载玻片定位标识的方法-CN202011057629.1有效
发明人： 彭广敦;江伏青 -专利权人：生物岛实验室
申请日： 2020-09-29 - 公布日： 2021-05-04 - 主分类号： B01L3/00 文献下载
摘要：本公开实施例公开了一种微流控芯片、用于空间组学测序及载玻片定位标识的方法，所述微流控芯片包括：第一芯片；所述第一芯片包括：芯片基体以及设置于芯片基体上的若干微流体通道；所述芯片基底包括：进样孔区域、样品标记区域以及出样孔区域；进样孔区域设置有若干进样孔；样品标记区域为所述芯片基体盖在载玻片上的样品上对应的区域；微流体通道的数量与所述进样孔相同，若干所述微流体通道之间具有间隔，且每个所述微流体通道连通一个所述进样孔；所述出样孔区域设置有数量少于所述进样孔的出样孔，与所述微流体通道连通；该技术方案通过减少了出样孔的数量以增加进样孔的数量，从而提高了对样品的标记组合的数量，也提高了样品的标记面积。
微流控芯片用于空间组学测序载玻片定位标识方法

[发明专利]空间组学测序、单细胞表观转录组学测序及定位标识方法-CN202011057632.3在审
发明人： 彭广敦;江伏青;瞿芳芳 -专利权人：生物岛实验室
申请日： 2020-09-29 - 公布日： 2020-12-29 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本公开实施例公开了一种空间组学测序、单细胞表观转录组学测序及定位标识方法，所述空间组学测序方法包括：预处理样品切片；利用微流控芯片将交叉定位标识添加至所述样品切片，其中，所述交叉定位标识为向微流控芯片的进样孔加入的包括不同barcode的物质所确定的；依序对所述样品切片进行细胞裂解、扩增及建库后，根据所述交叉定位标识进行基因测序。上述测序方法利用微流控芯片加入标记细胞位置的包括不同barcode的物质，操作步骤简单，并且不限于空间转录组测序、空间蛋白组测序、空间表观组测序和空间表观转录组测序等，应用范围广。
空间组学测序单细胞表观转录定位标识方法