本发明公开了调控植物种子和器官大小的小肽及其编码基因和应用。本发明具体地公开了氨基酸序列是SEQ ID No.1的多肽AtZSP1(AtZSP1小肽)及其编码基因在调控植物种子和器官大小中的应用。本发明利用T‑DNA插入突变体库,采用反向遗传学的方法,依据生物信息学分析,首次成功鉴定了一个参与调控拟南芥种子和器官大小的基因,命名为AtZSP1基因,并通过基因工程的方法增加了植物种子和/或器官的大小,获得了AtZSP1超表达植株,为小肽的开发和应用领域丰富了优质的基因资源,可以很好地应用于作物品种的改良,提高作物产量,对植物育种工作具有重要的实用价值。