一种基于Point Set Registration的医学本体对齐方法，本发明涉及医学本体对齐方法。本发明的目的是为了解决现有医学知识图谱融合的准确率低，数据匹配精度差，数据处理量大的问题。过程为：一、得到概念的向量表示；二、建立混合高斯模型；三、得到变换关系；四、将向量表示通过变换关系映射到同一向量空间中；五、在该向量空间中，对于一组医学本体中的某一个概念，在该概念对应的嵌入后向量的给定阈值半径内，若存在另一组医学本体中的概念的嵌入后向量，则这两组医学本体对象存在对齐关系；六、判断是否出现新的对齐，若是则利用新的对齐关系生成新的三元组正例，执行一；若否输出结果。本发明用于医学知识图谱领域。
