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[发明专利]一种病原微生物β多样性分析绘图方法-CN202211498110.6在审
发明人： 何灵江;雷鸣;王梦琪 -专利权人：苏州元华生物科技有限公司
申请日： 2022-11-29 - 公布日： 2023-08-04 - 主分类号： G16B50/00 文献下载
摘要：本发明涉及宏基因组技术领域。一种病原微生物β多样性分析绘图方法，本发明为分析病原微生物与环境因素或宿主之间的关系，寻找标志性菌群或特定功能的基因，本发明利用软件对β多样性度量时空尺度上物种组成的变化进行统计,对β多样性进行主成分分析以及可视化的绘图，已获得构成特定环境中微生物群体的构成情况或基因的组成以及功能，通过多元化的多种距离指数对物种组成数据进行的排序分析和绘图，能快速准确清晰的展示生物的多样性。
一种病原微生物多样性分析绘图方法

[发明专利]一种微生物多样性otu聚类与物种注释分析方法-CN202310397234.3在审
发明人： 何灵江;茹炳华;王梦琪 -专利权人：徐州泱锐生物科技有限公司
申请日： 2023-04-14 - 公布日： 2023-07-28 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明涉及宏基因组技术领域。一种宏基因组微生物多样性otu聚类与物种注释分析方法，本发明为解决宏基因组微生物样本测序结果中的菌种、菌属等数目信息的物种组成问题，在系统发生学或群体遗传学研究中，为了便于进行分析，人为给某一分类单元（品系、属、种、分组等）设置的统一标志即为OTU(Operational Taxonomic Units)，本发明对所有样本的effective Tags，以97%的一致性（Identity）进行OTUs聚类，在聚类过程中去除嵌合体序列，为了得到每个otu对应的物种分类信息，本发明采用RDP classifier贝叶斯算法对97%相似水平的otu代表序列进行分类学分析，并分别在各个分类水平：domain（域），kingdom（界），phylum（门），class（纲），order（目），family（科），genus（属），species（种）统计各样本的群落组成。
一种微生物多样性 otu 物种注释分析方法

[发明专利]一种宏基因组磷元素循环注释绘图方法-CN202211498205.8在审
发明人： 何灵江;雷鸣;王梦琪 -专利权人：苏州元华生物科技有限公司
申请日： 2022-11-29 - 公布日： 2023-07-28 - 主分类号： G16B50/10 文献下载
摘要：本发明涉及宏基因组技术领域。一种宏基因组磷元素循环注释绘图方法，本发明为解决宏基因组缺乏专门用于磷元素循环功能的数据库，且输出图谱及确定代谢途径复杂、数据量大等问题，本发明利用软件对以宏基因组测序方式获得的高质量微生物基因组进行磷代谢基因注释，通过绘制循环模式图，确定磷代谢过程所涉及的功能基因及其丰度，对微生物群落磷元素循环能力进行分析及比较，并通过对识别到的相关功能基因所属物种进行分类学注释，识别样本中参与磷循环的主要功能微生物种属，实现对宏基因组数据进行深入挖掘，通过多元化的方式分析结果的同时，还可以绘制清晰简洁的磷元素循环途径示意图，能快速准确的定位目标基因。
一种宏基元素循环注释绘图方法

[发明专利]一种基于宏基因组测序的致病真菌基因组survey分析方法-CN202211471217.1在审
发明人： 何灵江;雷鸣;王梦琪 -专利权人：苏州元华生物科技有限公司
申请日： 2022-11-23 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明涉及宏基因组技术领域。一种基于宏基因组测序的致病真菌基因组survey分析方法，本发明为解决数据库中公布基因序列的真菌物种比较少，尤其致病真菌稀缺，使得真菌基因组数据缺乏参考序列，无法获得基因大小、GC含量、杂合度、重复序列等信息的问题，本发明利用软件对宏基因组测序得到的致病真菌基因组进行survey分析，实现真菌基因组原始数据的质控、kmer分析、初步组装、组装结果评估，对预估基因组大小、评估基因组杂合度及重复序列、评估测序质量（错误率）、检查样本纯度、区分物种或判断物种间亲缘关系远近进行确定，从而通过一键化的方法快速确定未知致病真菌的背景信息，指导后续快速、高效、准确的获得致病真菌基因组的完成图。
一种基于宏基组测序致病真菌基因组 survey 分析方法

[发明专利]一种宏基因组病原微生物基因组基因功能注释绘图方法-CN202211472131.0在审
发明人： 何灵江;雷鸣;王梦琪 -专利权人：苏州元华生物科技有限公司
申请日： 2022-11-23 - 公布日： 2023-05-05 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明涉及宏基因组技术领域。一种宏基因组病原微生物基因组基因功能注释绘图方法，本发明为解决宏基因组病原微生物基因组功能分析不清晰，且输出的结果文件不能直观的展示基因组基因信息等问题，本发明利用软件对预测到的编码基因做功能注释，获得每个基因的功能信息，结合NR、KEGG、COG‑KOG、GO等数据库，通过比对方式获得最佳比对信息，最终获得病原微生物基因组对应的近缘物种、通路、蛋白家族、GO号等信息，解码微生物的基因组信息，并展示基因组信息背后的复杂代谢网络和调控网络，从而通过一键化的操作使数据绘制更快速准确，结果以图片形式输出使功能信息更直观化。
一种宏基病原微生物基因组基因功能注释绘图方法

[发明专利]一种宏基因组病原微生物多样性物种组成绘图方法-CN202211451207.1在审
发明人： 何灵江;雷鸣;王梦琪 -专利权人：苏州元华生物科技有限公司
申请日： 2022-11-20 - 公布日： 2023-05-02 - 主分类号： G06F8/34 文献下载
摘要：本发明涉及宏基因组技术领域。一种宏基因组病原微生物多样性物种组成绘图方法，本发明为解决宏基因组病原微生物物种组成多样性分析不清晰，且输出的结果文件不能直观的展示输出物种间的关系等问题，本发明利用软件对获得的病原微生物多样性的物种注释后进行物种组成绘图，主要在界、门、纲、目、科、属、种这7个分类水平上分析样本中微生物群落的物种组成，即可以分析单个样本，又可以多个样本之间进行比较，同时将结果绘制成图片形式，使得最终得到的病原微生物物种组成数据能直观化、可视化的转换为病原微生物的物种韦恩图、群落结构图、群落热图、优势物种群落结构图、单样本多级物种组成图、分类学系统组成树图等，从而通过多元化的方式更好的展示病原微生物物种组成；并且数据绘制更快速准确，结果以图片形式输出对比更直观化。
一种宏基病原微生物多样性物种组成绘图方法

[发明专利]长翼蝠瘦素蛋白及其cDNA序列-CN200910039439.4无效
发明人：原丽红;张树义;林本夫;左学国;何灵江;陈金平 -专利权人：广东省昆虫研究所
申请日： 2009-05-13 - 公布日： 2010-04-07 - 主分类号： C07K14/575 文献下载
摘要：本发明公开一种长翼蝠的瘦素蛋白及其cDNA序列，该瘦素蛋白为一种具有SEQ ID NO：3所示氨基酸序列的蛋白质，或在氨基酸序列(i)中，由缺失、取代或加成1个或几个氨基酸的氨基酸序列所组成，且与氨基酸序列(i)的蛋白质具有相同功能的蛋白质。本发明采用GST重组表达技术和凝血酶酶切除去GST标记物，从冬眠动物——长翼蝠中提取得到瘦素蛋白，细胞活性分析结果表明该长翼蝠瘦素蛋白具有明显的脂肪降解活性，可用于制备减肥药物、治疗糖尿病药物、治疗高血压药物以及治疗脂肪肝药物等。
长翼蝠瘦素蛋白及其 cdna 序列

[发明专利]马铁菊头蝠瘦素蛋白及其cDNA序列-CN200910039438.X无效
发明人：原丽红;张树义;林本夫;何灵江;左学国;陈金平 -专利权人：广东省昆虫研究所
申请日： 2009-05-13 - 公布日： 2010-01-06 - 主分类号： C07K14/575 文献下载
摘要：本发明公开一种马铁菊头蝠的瘦素蛋白及其cDNA序列，该瘦素蛋白为一种具有SEQ ID NO：3所示氨基酸序列的蛋白质，或在氨基酸序列(i)中，由缺失、取代或加成1个或几个氨基酸的氨基酸序列所组成，且与氨基酸序列(i)的蛋白质具有相同功能的蛋白质。本发明采用GST重组表达技术和凝血酶酶切除去GST标记物，从冬眠动物——马铁菊头蝠中提取得到瘦素蛋白，细胞活性分析结果表明该马铁菊头蝠瘦素蛋白具有明显的脂肪降解活性，可用于制备减肥药物、治疗糖尿病药物、治疗高血压药物以及治疗脂肪肝药物等。
马铁菊头蝠瘦素蛋白及其 cdna 序列

[发明专利]棕果蝠瘦素蛋白及其cDNA序列-CN200910039440.7无效
发明人：原丽红;张树义;陈金平;林本夫;左学国;何灵江 -专利权人：广东省昆虫研究所
申请日： 2009-05-13 - 公布日： 2009-09-30 - 主分类号： C07K14/575 文献下载
摘要：本发明公开一种棕果蝠的瘦素蛋白及其cDNA序列，该瘦素蛋白为一种具有SEQ ID No：3所示氨基酸序列的蛋白质，或在氨基酸序列(i)中，由缺失、取代或加成1个或几个氨基酸的氨基酸序列所组成，且与氨基酸序列(i)的蛋白质具有相同功能的蛋白质。本发明采用GST重组表达技术和凝血酶酶切除去GST标记物，从棕果蝠中提取得到瘦素蛋白，细胞活性分析结果表明该棕果蝠瘦素蛋白具有明显的脂肪降解活性，可用于制备减肥药物、治疗糖尿病药物、治疗高血压药物以及治疗脂肪肝药物等。
棕果蝠瘦素蛋白及其 cdna 序列

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