本发明公开一种鉴定6种畜类的MNP标记位点、引物组、试剂盒,以及其在鉴定6种畜类及其肉制品中的应用。所述MNP标记位点为在6种畜类基因组上筛选的具有物种特异性的、且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域。所述引物组包括第1引物对至第18引物对中的至少一对,如SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:36所示。本发明提供的包括所述引物组的试剂盒能在一个检测中对6种畜类的多个标记进行高效、准确和灵敏的检测,实现对6种畜类及其肉制品进行高通量、高效率、高准确性的检测和区分,为畜类及其肉制品的掺假鉴别和溯源分析提供技术支撑。