应用DNA条形编码鉴定鸡品种的方法属于分子生物学技术领域。本发明的技术方案是这样实现的:利用DNA测序技术测定受测鸡群体与标准对照样品的线粒体细胞色素C氧化酶I(cytochrome C oxidase I COI)基因序列,根据测序的COI序列中的突变位点、单倍型、单倍型多样度(Hd)、核苷酸多样度(Pi)、品种间双参数模型遗传距离、品种间核苷酸分歧度、各品种的特异位点及品种的DNA分类图进行鸡品种鉴定。与应用表型性状、生产性能、生化标记和其他遗传标记等方法相比,本发明更能真实的反映品种间的差异。其结果可作为鉴定鸡品种真伪的科学依据。