本发明公开了一种高产三萜灵芝新菌株HMGIM‑D150696及其分子标记和人工栽培方法。灵芝(Ganoderma lucidum)HMGIM‑D150696,保藏编号为GDMCC No:62403;其分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示;其人工栽培方法包括菌丝培养、出芝管理和采收。本发明获得差异位点的方法与传统的采用随机引物扩增的方式相比,具有效率高、特异性位点丰富的优点,可更有效保护菌种。此外,由于该菌株采集自野外,具有丰富的遗传变异,与市场流通品种存在较远的亲缘关系,可为优良新品种的选育提供宝贵的种质资源。