本发明涉及一种检测MTHFR基因化疗药物相关SNP位点的引物组及其方法。其中引物组包括第一引物组和第二引物组,第一引物组的的正向引物为SEQ ID NO:3所示序列,反向引物为SEQ ID NO:4所示序列;第二组引物的正向引物为SEQ ID NO:5所示序列,反向引物为SEQ ID NO:6所示序列。这本发明的有益效果在于本发明的技术方法是一种体外检测方法,对人体无害;本发明通过测序技术检测样本MTHFR基因677位点和1298位点的基因型,对拟使用化疗药物5-氟尿嘧啶或氨甲喋呤的病人进行个体化用药指导,可提高疗效,降低毒副作用。