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[发明专利]基于生物云平台的测序数据分析系统及方法-CN201910560395.3在审
发明人：郑洪坤;刘东源;罗江华;苗蓉;魏铮;白洁;刘威 -专利权人： 北京百迈客云科技有限公司
申请日： 2019-06-26 - 公布日： 2019-10-18 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明实施例提供一种基于生物云平台的测序数据分析系统及方法，包括用户界面模块，用于获取待分析的测序数据，并将测序数据发送到特征提取模块；特征提取模块，用于对接收到的测序数据进行特征提取处理，得到测序数据特征值，根据测序数据特征值获取对应的样本测序数据，并将样本测序数据发送到图表呈现模块；图表呈现模块，用于接收特征提取模块发送的样本测序数据，并将样本测序数据转换成可视化样本图表进行显示；云端综合分析模块，用于根据可视化样本图表对测序数据进行分析，并将分析结果数据发送到图表呈现模块，以生成可视化测序报告图表。本发明实施例提高了测序数据的处理效率，使得测序数据分析方式更加多样化。
测序数据样本特征提取模块呈现模块可视化分析系统云平台用户界面模块综合分析模块特征值获取报告图表处理效率特征提取数据发分析测序云端发送转换

[发明专利]基于生物云平台的文章和数据的检索和自动下载系统-CN201610687029.0有效
发明人：郑洪坤;刘祖明;杨峻;张增金;刘东源 -专利权人： 北京百迈客云科技有限公司
申请日： 2016-08-18 - 公布日： 2019-07-12 - 主分类号： G06F16/33 文献下载
摘要：本发明公开一种基于生物云平台的文章和数据的检索和自动下载系统，所述系统包括：数据下载模块、数据解析模块、数据存储模块、web图形化界面模块和数据检索模块。原始数据下载后，被解析成标准格式并对这些标准格式数据进行整合，然后按照预定的分词策略进行分词、建立索引并进行存储，提供检索接口。本发明通过将凌乱的原始数据按照固定的规律解析成标准格式并存储到一个检索集群中，并提供web界面供用户进行文章和数据的检索、浏览，便于对数据进行再次利用和研究。
基于生物平台文章数据检索自动下载系统

[发明专利]生物信息分析任务运行监控系统-CN201610666198.6有效
发明人：刘宝平;刘祖明 -专利权人： 北京百迈客云科技有限公司
申请日： 2016-08-12 - 公布日： 2019-01-04 - 主分类号： G06F11/32 文献下载
摘要：本发明公开一种生物信息分析任务运行监控系统，包括：WEB图形化用户界面模块、任务准备投递模块、任务扫描监控模块、任务推送反馈模块。所述任务准备投递模块、任务扫描监控模块和任务推送反馈模块使用队列调度，当任务进入该系统后，会将该任务投递到相应的集群上运行，当扫描到该任务已运行完成，则将其运行结果推送给用户，WEB图形化用户界面模块则全程可以看到该任务的运行相关信息，最终可以看到任务的运行结果，实现用户一键投递任务，任务全程自动运行、监控处理及反馈。
生物信息分析任务运行监控系统

[发明专利]一种读取对象存储系统中数据的方法以及装置-CN201610490651.2在审
发明人：郑洪坤;李明华;刘戈;杨峻;张增金 -专利权人： 北京百迈客云科技有限公司
申请日： 2016-06-28 - 公布日： 2016-12-07 - 主分类号： G06F17/30 文献下载
摘要：本发明公开一种读取对象存储系统中数据的方法以及装置。其中，所述方法包括：将所述对象存储系统挂载到内核fuse模块在用户空间创建的用户空间文件系统中；针对每个客户端配置相应的映射文件，并根据所述映射文件及具体的文件操作生成所述对象存储系统中存储对象的属性信息；根据所述存储对象的属性信息通过rest服务接口从所述对象存储系统的存储区中请求数据资源，从而实现数据的读取。通过本发明，减轻了原有基础架构对于存储的压力，优化了计算节点的处理流程。
一种读取对象存储系统数据方法以及装置

[发明专利]一种读写对象存储系统中的数据的方法以及装置-CN201610490654.6在审
发明人：郑洪坤;李明华;杨峻;张增金 -专利权人： 北京百迈客云科技有限公司
申请日： 2016-06-28 - 公布日： 2016-11-23 - 主分类号： G06F17/30 文献下载
摘要：本发明公开一种读写对象存储系统中的数据的方法以及装置。其中，所述方法包括：将对象存储系统挂载到内核fuse模块在用户空间创建的用户空间文件系统中，并配置每个客户端到对象存储系统中存储空间的路径信息；若客户端读取存储对象，先从用户空间文件系统的缓存中读取数据，若缓存中没有要读取的数据，则根据用户空间文件系统数据库中存储对象的元数据信息封装rest服务接口，通过rest服务操作对象存储系统中的存储对象，实现对象存储系统中的数据的读取；若客户端写入文件，用户空间文件系统根据文件大小和分块大小，将文件分割成一个或多个分块文件，写入本地缓存，并存储文件属性信息和分块信息，及调用rest服务将缓存中的分块写入对象存储系统，并记录存储对象的元数据信息。
一种读写对象存储系统中的数据方法以及装置

[发明专利]肿瘤外显子组测序分析系统及方法-CN201610316928.X在审
发明人：郑洪坤;张增金;孔关义;李俊晖;梁运鹏 -专利权人： 北京百迈客云科技有限公司
申请日： 2016-05-12 - 公布日： 2016-10-12 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明提供肿瘤外显子组测序分析系统及方法。所述分析系统包括Web交互单元、Java交互单元和数据分析单元。其中Web交互单元用于以Web方式接收肿瘤外显子组测序数据和测序参数；Java交互单元用于对接收的数据和参数，生成测序分析任务；数据分析单元用于根据生成的任务，读取所述肿瘤外显子组测序数据，并通过调用生物信息学软件库和脚本库，对数据进行分析，获取分析结果。本发明提供的肿瘤外显子组测序分析系统及方法，通过调用高效准确的生物信息学软件和个性化分析模块，一键式完成肿瘤外显子组测序分析流程，提高了测序效率；此外，本发明还具有保存肿瘤外显子组测序分析结果，进行二次查询检索的功能，节省了科研成本，有助于更深入地挖掘数据信息。
肿瘤外显子组测序分析系统方法

[发明专利]人基因组重测序数据分析系统及方法-CN201610317618.X在审
发明人：郑洪坤;张增金;刘威;塔拉 -专利权人： 北京百迈客云科技有限公司
申请日： 2016-05-12 - 公布日： 2016-10-12 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：本发明提供一种专门针对人基因组重测序数据的分析系统及方法。所述分析系统包括Web交互装置、基础服务模块和数据分析平台。其中Web交互装置用于以Web方式接收用户输入的人基因组重测序数据和参数，并将结果展示给用户；基础服务模块用于对接收的数据和信息生成分析任务；数据分析平台用于根据生成的任务，读取基因组数据，并调用生物信息学软件和数据库，对数据进行分析，获取分析结果。本发明提供的人基因组重测序数据分析系统及方法，通过调用高效准确的生物信息学软件和个性化分析模块，简化了基因组重测序数据分析流程，提高了分析质量及检测结果的准确率，节省了计算机运行时间，同时还能使用户进行数据的重复分析和查询，节省了科研成本。
基因组序数分析系统方法

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