本发明公开了GhKV3WRKY29基因及其蛋白在提高植物抗大丽轮枝菌黄萎病中的应用，属于基因工程领域。GhKV3WRKY29基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，该基因编码的蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。本发明通过从高抗黄萎病棉花品种中植棉KV3叶片中克隆获得抗黄萎病基因GhKV3WRKY29，通过VIGS沉默该基因，使陆地棉品种的抗大丽轮枝菌黄萎病的能力丧失，超表达则提高了拟南芥抗大丽轮枝菌黄萎病的性能。因此，GhKV3WRKY29基因可以作为遗传改良感黄萎病优质高产农作物品种提供抗病候选基因。
本发明公开了与黄萎病抗性相关的GhAGD13基因及其应用。本发明提供了如下1)～3)中任一所述的DNA分子在增强或降低植物对黄萎病抗性中的应用：1)其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示的DNA分子；2)其核苷酸序列如SEQ ID No.3所示的DNA分子；3)其核苷酸序列如SEQ ID No.4所示的DNA分子。研究棉花GhAGD13基因在抗黄萎病中的作用，为利用分子育种方法培育抗病品种提供目标基因奠定基础。
