[发明专利]一种面向特定疾病领域的医疗健康知识图谱系统

说明书

本发明公开一种面向特定疾病领域的医疗健康知识图谱系统，涉及数据处理技术领域，包括：数据采集模块，用于根据医生需求采集医院的电子病历；概念图谱构建模块，用于借助医生工作中使用的工具集，根据获取的电子病历构建概念知识图谱；实例图谱构建模块，用于借助医生工作中使用的工具集，从电子病历中抽取实体、事件、关系，构建实例知识图谱；整合模块，用于借助医生工作中使用的工具集，将概念知识图谱和实例知识图谱的节点融合，得到多个特定疾病领域的知识图谱。本发明能够构建多个特定疾病领域的知识图谱，提高医疗健康知识图谱构建的准确率，具有重复利用、可扩展的优点。

技术领域

本发明涉及数据处理技术领域，具体的说是一种面向特定疾病领域的医疗健康知识图谱系统。

背景技术

自2012年以来，知识图谱一直是研究的焦点，这一概念最初由谷歌提出，用来增强其搜索引擎的语义理解能力。知识图谱的定义是一种基于图的数据结构，由节点(实体)和标记边(实体之间的关系)组成。通常，将仅具有概念节点的知识图谱定义为概念知识图谱(Concept KnowledgeGraph:CKG)，将具有实例节点和事件节点的知识图谱作为实例知识图谱(Instance KnowledgeGraph:IKG)，以及将同时包含CKG和IKG作为事实知识图谱(Factual KnowledgeGraph:FKG)。

常规知识图谱的构建系统架构主要包括以下内容:知识表示，知识图谱构建工具，如信息抽取和融合工具，以及知识的存储和应用。但是，常规策略不能直接应用于特定领域的知识图谱，更不用说构建更专业的面向特定疾病领域的知识图谱。原因之一是构建专业的特定疾病知识图谱需要抽取来自特定数据源的特定实体和关系，并且需要构建针对不同疾病的专用语义网络。

目前的医疗健康知识图谱通常涵盖广泛的医学知识领域:所有蛋白质(UniProt)，尽可能多的药物(Drugbank)，已知的许多药物及其之间的相互作用(Sider)，以及大量整合的知识图谱，如Bio2RDF和LinkedLifeData。

众所周知，在医学领域，一方面，有各种疾病、许多复杂的概念和关系，需要医生提供大量具体的先验知识来帮助辨识它们，更重要的是，医生对不同疾病的实际需求可能各不相同；另一方面，数据获取的困难以及来自疾病领域的先验知识的缺乏，一次性构建涵盖所有疾病领域的医疗健康知识图谱是十分困难的。

发明内容

本发明针对目前技术发展的需求和不足之处，提供一种面向特定疾病领域的医疗健康知识图谱系统。

本发明的一种面向特定疾病领域的医疗健康知识图谱系统，解决上述技术问题采用的技术方案如下：

一种面向特定疾病领域的医疗健康知识图谱系统，其结构框架包括：

数据采集模块，用于根据医生需求采集医院的电子病历；

概念图谱构建模块，用于借助医生工作中使用的工具集，根据获取的电子病历构建概念知识图谱；

实例图谱构建模块，用于借助医生工作中使用的工具集，从电子病历中抽取实体、事件、关系，构建实例知识图谱；

整合模块，用于借助医生工作中使用的工具集，将概念知识图谱和实例知识图谱的节点融合，得到多个特定疾病领域的知识图谱。

可选的，所涉及医院的电子病历包括专业医院治疗特定疾病的临床数据、主任医师及以上级别的诊断数据和治疗数据，前述数据分为结构化数据和非结构化数据。

进一步可选的，所涉及医生工作中使用的工具集包括医生输入工具、医生标注工具、规则库工具、ER-OWL映射工具；

概念图谱构建模块借助医生输入工具、规则库工具、ER-OWL映射工具构建概念知识图谱；

实例图谱构建模块借助医生标注工具、规则库工具、ER-OWL映射工具构建实例图谱。