[发明专利]一种循环肿瘤细胞的计数算法及应用在审
申请号: | 201910368036.8 | 申请日: | 2019-05-05 |
公开(公告)号: | CN109991205A | 公开(公告)日: | 2019-07-09 |
发明(设计)人: | 熊欣;张为国;张之胜;朱晓强 | 申请(专利权)人: | 中国科学院重庆绿色智能技术研究院 |
主分类号: | G01N21/64 | 分类号: | G01N21/64;G01N15/10;G01N1/30 |
代理公司: | 北京元本知识产权代理事务所 11308 | 代理人: | 黎昌莉 |
地址: | 400714 *** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 循环肿瘤细胞 检测 系列图像 肿瘤细胞 去除 倒置荧光显微镜 体外药敏试验 个体化治疗 采集检测 分析计算 跟踪监测 计数算法 计算循环 检测芯片 空洞填充 疗效评估 免疫染色 人员分析 完整图像 细胞识别 信息呈现 荧光通道 拍摄 微流控 富集 拼接 噪声 应用 扫描 癌症 芯片 诊断 | ||
1.一种计算循环肿瘤细胞的方法,其特征在于,通过倒置荧光显微镜扫描拍摄富集免疫染色的肿瘤细胞的芯片的所有区域,拼接拍摄荧光通道的系列图像成完整图像,再经去除背景、去除噪声、空洞填充、黏连细胞识别来分析计算循环肿瘤细胞个数。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述循环肿瘤细胞为使用微流控循环肿瘤细胞检测芯片收集的循环肿瘤细胞。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述观测通道为4个,其中包括1个白光通道、3个荧光染色剂对应的荧光通道。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述系列图片拼接成完整全图的算法采用平方差匹配、标准平方差匹配、相关匹配和标准相关匹配中的一种或几种。在图像清晰的情况下,四种匹配方式均可匹配成功,用户可根据需要选择匹配方式得到最佳效果的全图。若图片质量不佳,依次采用四种匹配方式,直到匹配成功为止。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,采用中值滤波来去除噪声,再将全图进行去除背景、二值化处理。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,采用孔洞填充算法进行黏连细胞的初步识别。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,采用分水岭算法来进一步识别黏连细胞。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,对于分水岭算法无法识别的黏连细胞,采用手动识别。
9.权利要求1-8任一项所述的计算循环肿瘤细胞的方法在计算癌症早期血液中循环肿瘤细胞中应用。
10.平方差匹配和/或标准平方差匹配和/或相关匹配和/或标准相关匹配和中值滤波和二值化和孔洞填充算法和分水岭算法在计算循环肿瘤细胞中的应用,其特征在于,所述计算循环肿瘤细胞的方法包括对系列图像的拼接,拼接成全图之后,全图图像的去除背景、去除噪声、空洞填充和黏连细胞识别。
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