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[发明专利]一种构建同时表达多个基因的重组表达载体的方法-CN201010294951.6有效
发明人：陈其军;王学臣;陈珈;谢敏 -专利权人：中国农业大学
申请日： 2010-09-26 - 公布日： 2011-02-23 - 主分类号： C12N15/63 文献下载
摘要：菌株包括供体菌和受体菌，载体包括供体载体和受体载体。供体菌染色体上携带的复制起始蛋白负责自杀式供体载体的复制扩增，携带的接合转移蛋白Tra负责供体载体的接合转移。受体菌能够诱导表达两套位点特异性重组蛋白：Cre重组酶和λ噬菌体位点特异性重组蛋白。当混和供体菌和受体菌时，供体菌和受体菌发生接合生殖，供体菌中的供体载体由于携带oriT元件而转移到受体菌中；在受体菌中供体载体和受体载体在两套位点特异性重组酶的作用下发生重组反应，导致供体载体上携带的目标基因组装到受体载体上
一种构建同时表达基因重组载体方法

[发明专利]一种食用菌栽培方法及其水肥供体床架-CN201310384089.1无效
发明人：文国林 -专利权人：文国林
申请日： 2013-08-21 - 公布日： 2014-01-01 - 主分类号： A01G1/04 文献下载
摘要：本发明提供了一种食用菌栽培方法及其水肥供体床架，其特征在于将(5)食用菌(例如杏鲍菇平菇金针菇等)培养基(例如菌包菌块等)分为出菇端和水肥吸收端，食用菌(例如杏鲍菇平菇金针菇等)培养基(例如菌包菌块等)立体堆叠摆放于水肥供体床架之上，(7)食用菌培养基出菇端均朝向水肥供体床架外侧，(6)食用菌培养基水肥吸收端均朝向水肥供体床架内侧的(2)水肥供体区并与(2)水肥供体区内装填的(8)水肥供体连通接触，从中直接获取水肥供应；水肥供体床架由(1)支架(2)水肥供体区(3)食用菌培养基放置区等部分构成。本发明可以改善食用菌出菇期水肥供应条件，提高食用菌产质量。
一种食用菌栽培方法及其水肥供体床架

[发明专利]一种全菌胶囊及其制备方法和应用-CN202011002001.1有效
发明人：陆敏;张宝钰;刘丹;张水龙;王一伟;朱永亮;朱蒙蒙 -专利权人：苏州普瑞森生物科技有限公司
申请日： 2020-09-22 - 公布日： 2022-07-15 - 主分类号： C12N1/20 文献下载
摘要：本发明提供了一种全菌胶囊及其制备方法和应用，所述制备方法包括以下步骤：(1)利用高通量测序筛选粪菌供体；(2)收集步骤(1)筛选的粪菌供体的粪便，制备粪菌液；(3)将步骤(2)制备的粪菌液和冻干保护剂混合后进行降温冷冻和真空干燥，得到的粪菌冻干粉装入胶囊壳内，得到所述全菌胶囊。本发明利用高通量测序对粪菌供体进行筛选，实现了快速筛选出针对不同的粪菌受体的粪菌供体，由此制备的全菌胶囊与粪菌受体精确匹配，药效显著。
一种胶囊及其制备方法应用

[发明专利]一种肠道菌群移植治疗溃疡性结肠炎的供受体配型方法-CN202011527189.1有效
发明人：肖传兴;张帮周;曹曼;杨璐溪;何剑全;林爱强 -专利权人：厦门承葛生物科技有限公司
申请日： 2020-12-22 - 公布日： 2023-01-10 - 主分类号： G16H50/70 文献下载
摘要：本发明公开了一种肠道菌群移植治疗溃疡性结肠炎的供受体配型方法，属于临床医疗技术领域，包括如下步骤：(S1)：收集临床溃疡性结肠炎患者受体以及健康人员供体的肠道菌群数据，建立数据库；(S2)：通过分析处理数据库数据，提取供体独有多样性、菌属分类单元、通路分类单元以及用以比较供体与受体之间组成差异的供受体距离数据组成特征，构建溃疡性结肠炎供受体配型模型；(S3)：配型模型通过层次分析法分解特征层次结构，对供体库中供体进行打分排序，选择最优值供体，使患者获得最优供体配型。本发明公开的肠道菌群移植治疗溃疡性结肠炎的供受体配型方法，便于患者匹配合适的菌群供体，以保证菌群移植治疗的有效性。
一种肠道移植治疗溃疡性结肠炎受体方法

[发明专利]一种肠道菌群超级供体画像信息检测生成方法-CN202310568770.5有效
发明人：董秀山;苗雄伟;张晓燕;高燕飞 -专利权人：山西智能大数据研究院有限公司;山西白求恩医院（山西医学科学院、华中科技大学同济医学院附属同济医院山西医院、山西医科大学第三医院、山西医科大学第三临床医学院）
申请日： 2023-05-19 - 公布日： 2023-08-08 - 主分类号： G16B5/00 文献下载
摘要：本发明提供一种肠道菌群超级供体画像信息检测生成方法，属于肠道菌群超级供体画像生成技术领域；所要解决的技术问题为：为克服目前针对画像生成方法的研究均没有涉及肠道菌群超级供体的缺陷，提供一种肠道菌群超级供体画像信息检测生成方法；解决该技术问题采用的技术方案为：首先从生理、心理、体检、生活史、生活习惯五个维度采集供体的数据信息，对采集数据进行预处理：包括删除唯一属性、NLP模型提取关键字、标签编码、数据缩放、去除异常值等处理步骤，并得到每个维度的原始特征集；基于聚类算法将每个维度的数据进行聚类，得到超级供体的初始特征；本发明应用于肠道菌群超级供体的画像生成。
一种肠道超级供体画像信息检测生成方法

[发明专利]一种肠道菌群移植供体的筛选方法-CN202010364321.5在审
发明人：肖传兴;何剑全;张帮周;杨璐溪;汪涵 -专利权人：厦门承葛生物科技有限公司
申请日： 2020-04-30 - 公布日： 2020-09-18 - 主分类号： G16H20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种肠道菌群移植供体的筛选方法。该法首先通过与供体沟通，告知供体菌群移植概念以及填写问卷的注意事项后，经供体基本信息登记、临床评估、胃肠道致病菌检测、血液检测的过程，筛选出合格的健康供体，有效期三个月。健康供体三个月后需要再次进行胃肠道致病菌检测、血液检测过程的筛查，只有再次筛选符合要求的供体方为合格供体。本发明致力于建立一个科学合理的菌群移植供体筛选方法，既能提高健康供体的素质，以最大程度的保证移植的安全性和有效性，同时也为国家制定相关的标准提供依据和参考。
一种肠道移植供体筛选方法

[发明专利]基于细胞的荧光共振能量传递(FRET)检测梭菌毒素-CN03822862.9有效
发明人： E·费尔南德斯－萨拉斯;L·E·斯图尔德;K·R·奥基 -专利权人：阿勒根公司
申请日： 2003-09-04 - 公布日： 2005-10-19 - 主分类号： G01N33/554 文献下载
摘要：本发明提供一种测定梭菌毒素活性的方法，所述方法包括(a)将含有梭菌毒素底物的细胞与样品接触，所述梭菌毒素底物包括一种供体荧光团；一种吸收光谱与供体荧光团的发射光谱有重叠的受体；一种含有切割位点的梭菌毒素识别序列，其中所述切割位点介于供体荧光团和受体之间，并且其中共振能量传递在适当条件下表现于供体荧光团和受体之间；(b)激活供体荧光团；并(c)测定接触过的细胞相对于对照细胞的共振能量传递，其中与对照细胞相比，接触过的细胞共振能量传递的变化表示梭菌毒素的活性
基于细胞荧光共振能量传递 fret 检测毒素

[发明专利]菌群移植配型的排序方法、系统、计算机设备及存储介质-CN202210034606.1有效
发明人：王科;黄伟斌 -专利权人：广州保量医疗科技有限公司
申请日： 2022-01-12 - 公布日： 2022-08-30 - 主分类号： G16H50/70 文献下载
摘要：本发明涉及临床医学技术领域，公开了菌群移植配型的排序方法、系统、计算机设备及存储介质。所述方法包括：建立配型训练集和菌群移植配型排序模型，使用所述配型训练集对所述菌群移植配型排序模型进行训练；建立供体数据搜索引擎，将训练好的所述菌群移植配型排序模型部署到所述供体数据搜索引擎的前端；将待配型受体数据输入所述供体数据搜索引擎，通过训练好的所述菌群移植配型排序模型，得到所述待配型受体数据与所述供体数据的匹配排序结果；所述供体数据搜索引擎将所述匹配排序结果作为所述待匹配受体数据的配型搜索结果进行输出。本发明能够对菌群移植时的受体和供体数据智能匹配，降低了配型计算复杂性，提高了计算效率和配型准确度。
移植排序方法系统计算机设备存储介质

[发明专利]肠道菌群移植配型的度量学习方法、系统、设备及介质-CN202111559769.3在审
发明人：黄伟斌;王科 -专利权人：广州保量医疗科技有限公司
申请日： 2021-12-17 - 公布日： 2022-05-13 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明涉及肠道菌群移植技术领域，公开了一种肠道菌群移植配型的度量学习方法、系统、设备及介质，所述方法包括：构建孪生神经网络；将供体数据和受体数据输入所述孪生神经网络进行训练，得到供体度量特征和受体度量特征；通过损失函数对所述供体度量特征和受体度量特征进行学习训练，并输出训练结果。本发明通过肠道菌群移植配型的度量学习方法、系统、设备及介质，利用孪生神经网络(Siamese Network)，对肠道菌群移植的供体和受体收据进行匹配度量学习,能够生成更加精准的匹配度量计算模型。而且使用Contrastive Loss损失函数训练匹配数据，学习出受体与供体的相似性量计算模型更加合理。
肠道移植度量学习方法系统设备介质

[发明专利]基于定量PCR技术评价细菌接合转移效率的方法-CN202111363429.3在审
发明人：邓益琴;司徒洁金;冯娟;陈皓祥 -专利权人：中国水产科学研究院南海水产研究所
申请日： 2021-11-17 - 公布日： 2022-03-22 - 主分类号： C12Q1/689 文献下载
摘要：本发明通过PCR扩增和无缝克隆构建含有受体菌同源序列的自杀质粒；并通过转化方式将其导入供体菌大肠杆菌；接着通过供体菌与受体菌的接合作用，将自杀质粒送入受体菌内，并与受体菌染色体上的同源序列发生同源重组，自杀质粒整合进入受体细胞；根据同源重组后的染色体序列，设计上游引物序列在受体菌染色体上、下游引物序列在质粒上的特异性检测引物，定量PCR的方式定量接合子数量，同时设计相对于供体菌的受体菌的特异性引物，定量受体菌总数量；最后，通过公式：接合效率＝接合子数量÷受体菌总量，得到接合效率。
基于定量 pcr 技术评价细菌接合转移效率方法

[发明专利]一种利用葡萄糖进行辅助微生物基因操作的方法-CN202110982255.2有效
发明人：路志群;邓自发 -专利权人：南通大学
申请日： 2021-08-25 - 公布日： 2023-04-18 - 主分类号： C12N15/74 文献下载
摘要：该方法为：将质粒pMV26N导入大肠杆菌DH10B(ΔPTS)后采用含有抗生素的LB液体培养基培养，得到活化供体菌；将Nocardioidessp.菌采用LB液体培养基培养，得到活化Nocardioidessp.菌；将活化供体菌和活化Nocardioidessp.菌混合后涂布基本培养基固体平板培养，涂布加有卡那霉素的无菌超纯水上层，培养20‑30h，获得成功导入质粒的Nocardioidessp.菌。该方法无需使用抗生素杀死供体菌，便可实现接合转移，且接合转移效果好。
一种利用葡萄糖进行辅助微生物基因操作方法

[发明专利]一种基于PFOR酶活性导向的FMT供体筛选方法及其应用-CN202210099285.3有效
发明人：梁思成;肖丽君;吕沐瀚;阳泰;钟晓琳;齐晓怡;邓明明 -专利权人：西南医科大学附属医院
申请日： 2022-01-27 - 公布日： 2023-09-19 - 主分类号： C12Q1/26 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于PFOR酶活性导向的FMT供体筛选方法，以艰难梭菌体内的PFOR酶为靶点，通过测试FMT供体提供的粪菌液对PFOR酶的抑制率，筛选预测和/或评价FMT对于艰难梭菌感染的治疗效果。本发明以艰难梭菌内的PFOR酶为靶点，通过培养带有PFOR酶质粒的大肠杆菌，并诱导其在IPTG的作用下产生PFOR酶，通过体外实验检测FMT供者所提供的粪菌液对PFOR酶的抑制率，即可初步判断基于该供体的FMT对于艰难梭菌感染的治疗疗效，可用于筛选FMT的供体，或者评价所提供的粪便质量的优劣，既避免了直接培养艰难梭菌的复杂过程，通过酶反应，即可推断FMT供者所提供的粪菌液对于艰难梭菌的抑制作用，且PFOR酶为艰难梭菌获取能量的步骤，对于艰难梭菌的意义重大。
一种基于 pfor 活性导向 fmt 供体筛选方法及其应用

[发明专利]一种菌群与供体免疫信息可溯源系统-CN201911162592.6在审
发明人：王京苏;王盛洲;李辉;周新路;黄小晶 -专利权人：江西善行生物科技有限公司
申请日： 2019-11-25 - 公布日： 2020-06-19 - 主分类号： G16H15/00 文献下载
摘要：本发明涉及一种菌群与供体免疫信息可溯源系统。目前国内缺乏用于整合搭建菌群与免疫大数据集及国人菌群与免疫健康档案的可溯源系统，使得管理菌群与供体免疫信息较为繁琐且容易出现漏差。本发明涉及一种菌群与供体免疫信息可溯源系统，其中：客户模块，用于普通用户(检测者)查询自己所有的检测记录；采样模块，用于采集员根据检测者的需求，选择不同的检测项目；实验模块，用于样本采好样后运输到实验室实现供体样本信息可视化、可追踪、可匹配全通路流程。可以极大程度减少项目成本，减少因样本信息前后错误导致的一连串不可估量的社会问题，提高项目工作效率。
一种供体免疫信息溯源系统

[发明专利]一株供体菌、其构建方法与应用以及质粒抑制剂筛选方法-CN201910355278.3有效
发明人：孙坚;李龚;黄昊旻;邹文瑾;吉俊柔;刁晓苑;江颖琳;何玉张;廖晓萍;刘雅红 -专利权人：华南农业大学
申请日： 2019-04-29 - 公布日： 2021-02-19 - 主分类号： C12N1/21 文献下载
摘要：本发明提供了一株供体菌、其构建方法与应用以及质粒抑制剂筛选方法。所述的供体菌包含自杀型荧光质粒和pCRISPR‑LUX质粒，该供体菌本身不表达荧光；而所述的自杀型荧光质粒可通过接合转移进入受体菌，由于接合子脱离了失去核酸内切酶活性的Cas9蛋白的抑制而可以表达荧光。本发明还提供了所述的供体菌的构建方法及应用，所述的应用为通过分析接合子的荧光表达情况对接合转移效率进行定量分析或质粒抑制剂的筛选。
供体构建方法应用以及质粒抑制剂筛选

[发明专利]一种检测多重耐药质粒水平转移的方法-CN202010998385.0在审
发明人：李蒙;张亚妮;梁海华 -专利权人：西北大学
申请日： 2020-09-21 - 公布日： 2021-01-26 - 主分类号： C12N15/78 文献下载
摘要：本发明公开了一种利用携带luxCDABE基因簇的受体菌检测多重耐药质粒水平转移能力的方法，包括融合载体构建、整合载体构建、荧光受体菌构建、供体菌和受体菌的接合本发明结合受体菌的荧光性和多重耐药质粒的耐药性，可以区分供体菌、受体菌和接合子，从而检测多重耐药质粒水平转移的能力。
一种检测多重耐药质粒水平转移方法

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