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[发明专利]表面改性的纳米粒子-CN201710878049.0在审
发明人：伊马德·纳萨尼 -专利权人：纳米技术有限公司
申请日： 2012-12-21 - 公布日： 2017-12-15 - 主分类号： C07D251/70 文献下载
摘要：通过将配体相互作用剂与纳米粒子的表面缔合制备表面改性的纳米粒子。所述配体相互作用剂结合至被调节为赋予特别的可溶性和/或相容性的表面改性配体。所述的配体相互作用剂经由连接/交联剂交联，如六甲氧基甲基三聚氰胺或其衍生物。所述的连接/交联剂可以提供用于将所述表面改性配体连接至所述配体相互作用剂的连接位点。
表面改性纳米粒子

[发明专利]表面改性的纳米粒子-CN201280063722.0有效
发明人：伊马德·纳萨尼 -专利权人：纳米技术有限公司
申请日： 2012-12-21 - 公布日： 2017-10-03 - 主分类号： C09K11/02 文献下载
摘要：通过将配体相互作用剂与纳米粒子的表面缔合制备表面改性的纳米粒子。所述配体相互作用剂结合至被调节为赋予特别的可溶性和/或相容性的表面改性配体。所述的配体相互作用剂经由连接/交联剂交联，如六甲氧基甲基三聚氰胺或其衍生物。所述的连接/交联剂可以提供用于将所述表面改性配体连接至所述配体相互作用剂的连接位点。
表面改性纳米粒子

[发明专利]配体分析-CN200480012675.2无效
发明人： A·D·安妮斯;H·M·纳什;C·莫亚莱米;W·H·李;C·D·阿克于兹;Z·郑;G·M·马卡拉 -专利权人：先灵公司
申请日： 2004-03-10 - 公布日： 2007-07-11 - 主分类号： G01N33/53 文献下载
摘要：本文描述的是分析受体－配体对的方法。该方法可提供与配体和受体的结合亲和力相关的信息，或者可以提供与配体和受体的结合动力学相关的信息。在某些情况中，该方法提供了一种非常全面的用于评估和/或优化受体－配体相互作用的系统，该系统可被应用于多种类型的受体－配体相互作用，例如蛋白质－小分子相互作用。
分析

[发明专利]一种配体-蛋白质相互作用的预测方法及装置-CN202010356774.3在审
发明人：蒋华良;郑明月;陈立凡 -专利权人：中国科学院上海药物研究所
申请日： 2020-04-29 - 公布日： 2021-10-29 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种配体‑蛋白质相互作用的预测方法及装置，包括：对目标蛋白质的一级序列进行处理，获得由特征向量组成的若干蛋白质特征序列；基于目标配体的分子指纹图谱获取目标配体的若干原子特征序列；基于所述若干蛋白质特征序列以及所述若干原子特征序列利用预设的预测模型进行预测，获得所述目标蛋白质和所述目标配体相互作用的概率。本发明实施例中当需要预测某个蛋白质和某个配体能否进行相互作用时，只需要获得该蛋白质的各蛋白质特征序列以及该配体的原子特征序列，通过利用预测模型，就能预测出蛋白中哪些氨基酸片段能和配体中哪些原子进行相互作用，由此能够计算出该蛋白质和该配体相互作用的概率。
一种蛋白质相互作用预测方法装置

[发明专利]G蛋白偶联受体-配体相互作用关系的预测方法及预测系统-CN201810329690.3在审
发明人：江振然;陶然;陈范曙 -专利权人：华东师范大学
申请日： 2018-04-13 - 公布日： 2018-10-12 - 主分类号： G06F19/16 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于多信息整合的G蛋白偶联受体(GPCR)‑配体相互作用的预测方法，其包括：构建非孤儿受体的G蛋白偶联受体‑配体相互作用网络结构图；将孤儿受体与非孤儿受体之间的受体‑受体关系嵌入到所述受体‑配体关系网络中，基于网络中节点之间的距离关系；构建受体‑配体作用对的特征关系，结合集成学习方法，实现了对受体‑配体潜在关系的有效预测。本发明方法针对GPCR及其配体的生物学特征，建立并实现适合G蛋白偶联受体‑配体相互作用关系的预测以及孤儿GPCR潜在配体的预测，实验表明该方法预测效果好，有较为广泛的应用前景。本发明还公开了一种基于多信息整合的G蛋白偶联受体(GPCR)‑配体相互作用的预测系统。
配体相互作用配体预测孤儿受体信息整合预测系统构建生物学特征网络结构图关系嵌入关系网络结合集成距离关系潜在关系特征关系与非应用网络学习

[发明专利]用于相互作用分析的方法和系统-CN201580006412.9有效
发明人： R·卡尔逊 -专利权人：通用电气健康护理生物科学股份公司
申请日： 2015-01-29 - 公布日： 2019-10-11 - 主分类号： G01N33/543 文献下载
摘要：一种评估流体样品中分析物和固定在生物传感器的传感器表面上的配体之间的相互作用的方法，其包括以下步骤：提供参考结合曲线，其表示预定采集周期的参考相互作用；使用生物传感器采集预定采集周期的分析物配体相互作用的样品结合曲线；记录样品结合曲线与参考结合曲线的偏差；并且当记录的偏差小于预定偏差标准时将分析物配体相互作用分类为等效于参考相互作用。
用于相互作用分析方法系统

[发明专利]一种分析配体-受体相互作用介导的细胞通讯方法-CN202211217739.9在审
发明人：彭利红;阳龙;谭经纬;周立前 -专利权人：湖南工业大学
申请日： 2022-09-30 - 公布日： 2023-04-04 - 主分类号： G16B35/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种分析配体‑受体相互作用介导的细胞通讯方法，首先收集多个配体‑受体相互作用数据集，其次通过一种结合了异构牛顿Boosting模型和深度神经网络的异构深度集成模型来筛选识别潜在的配体‑受体相互作用，第三基于单细胞转录组数据对组织中已知和预测到的配体‑受体相互作用进行过滤，第四基于过滤后的配体‑受体相互作用和表达阈值法、表达乘积法和联合评分策略预测细胞通讯，最后对细胞通讯结果可视化，该框架进一步应用于分析人类黑色素瘤组织和头颈部鳞状细胞癌组织中的细胞通讯
一种分析受体相互作用细胞通讯方法

[发明专利]配体调控的蛋白-蛋白相互作用系统-CN201880082884.6在审
发明人： M·特拉克斯迈尔;C·宾格;C·布雷;M·莱纳 -专利权人：圣安娜儿童癌症研究中心;维也纳农业大学
申请日： 2018-12-20 - 公布日： 2020-08-14 - 主分类号： C07K14/725 文献下载
摘要：公开了一种基于脂质运载蛋白折叠分子的配体调节的蛋白‑蛋白相互作用系统，其包含：(a)脂质运载蛋白折叠分子，(b)分子量为1500Da或以下的低分子量的脂质运载蛋白折叠配体，和(c)脂质运载蛋白折叠结合相互作用配偶体，其中脂质运载蛋白折叠分子可结合脂质运载蛋白折叠配体，并且其中结合脂质运载蛋白折叠配体的脂质运载蛋白折叠分子，其结合脂质运载蛋白折叠结合相互作用配偶体的亲和力是未结合脂质运载蛋白折叠配体的脂质运载蛋白折叠分子的亲和力的至少10倍，并且其中脂质运载蛋白折叠结合相互作用配偶体不是天然存在的蛋白，在任何脂质运载蛋白折叠配体的存在下，天然存在的蛋白与任何天然存在的脂质运载蛋白折叠分子的亲和力10μM。
调控蛋白相互作用系统

[发明专利]多路复用的受体-配体相互作用筛选-CN201880051978.7在审
发明人：斯里拉姆·科苏里;埃里克·琼斯 -专利权人：加利福尼亚大学董事会
申请日： 2018-07-05 - 公布日： 2020-05-08 - 主分类号： C12N5/0793 文献下载
摘要：本公开内容的方面涉及细胞群体，其中每个细胞包含：i)异源受体基因；ii)包含受体应答元件的诱导型报告物；其中所述报告物的表达依赖于由所述受体基因编码的受体的活性激活，并且其中所述报告物包含条形码，所述条形码包含对于异源受体基因独特的索引区；其中所述细胞表达不同异源受体，并且其中每个单一细胞表达一种特定异源受体的一个或多个拷贝和一种特定报告物的一个或多个拷贝。
多路复用受体相互作用筛选

[发明专利]蛋白质与配体分子的亲和力预测方法及装置-CN202210734651.8在审
发明人：任洁;黎浩添;刘伟 -专利权人：腾讯科技（深圳）有限公司
申请日： 2022-06-24 - 公布日： 2022-10-04 - 主分类号： G16B15/20 文献下载
摘要：本公开的实施例提供了一种蛋白质与配体分子的亲和力预测方法、装置、设备和计算机可读存储介质。本公开的实施例所提供的方法基于从蛋白质与配体分子结合的三维结构图中提取的节点特征、边特征和几何特征，通过预先训练的预测模型获得蛋白质与配体分子的亲和力，并获得用于指示蛋白质与配体分子的原子之间相互作用的相互作用图，在提升亲和力预测性能的基础上，能够判断所预测的蛋白质与配体分子的原子相互作用是否正确，使得预测结果具有可解释性。其中，该预测模型是通过对亲和力预测和相互作用图预测的误差校正获得的，因此通过本公开的实施例的方法能够在误差校正的基础上学习到更准确的亲和力预测和相互作用图预测。
蛋白质分子亲和力预测方法装置

[发明专利]基于蛋白-配体相互作用指纹图谱的药物靶标预测方法-CN201710309067.7有效
发明人：李国菠;吴勇;刘莎;于竹君 -专利权人：四川大学
申请日： 2017-05-04 - 公布日： 2020-03-10 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：基于蛋白‑配体相互作用指纹图谱的药物靶标预测方法。收集大量的多样化的靶标与配体复合物晶体结构，构建参考蛋白‑配体相互作用指纹图谱模型，采用分子对接预测待测药物与每个靶标的可能结合模式，建立药物与靶标的相互作用指纹图谱模型，计算指纹图谱与参考相互作用指纹图谱模型的相似性以及药物与靶标的亲和力本发明既采用了相互作用指纹图谱方法进行药物与靶标相互作用模式进行排序和预测，克服分子对接对药物与靶标相互作用模式预测成功率较低的缺点；又采用了综合指标Cvalue对靶标进行排序，发挥各个方法的优势，从根本上提高药物靶标的预测准确率
基于蛋白相互作用指纹图谱药物靶标预测方法

[发明专利]基于Boosting与深度森林及单细胞测序数据的细胞通讯预测方法及应用-CN202211213760.1在审
发明人：彭利红;刘龙龙;王钊;周立前 -专利权人：湖南工业大学
申请日： 2022-09-30 - 公布日： 2023-02-03 - 主分类号： G16B45/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于Boosting与深度森林及单细胞测序数据的细胞通讯预测方法及应用，在提取配体和受体生物特征的基础上，设计极限梯度提升算法选择配体‑受体对的特征。然后基于类别特征梯度提升算法、自然梯度提升算法和深度森林模型，设计集成框架预测配体‑受体相互作用。并结合肿瘤组织的单细胞测序数据，对已知的和预测的配体－受体相互作用数据进行过滤。再根据过滤后的的配体‑受体相互作用和单细胞测序数据，结合表达乘积法和表达阈值法对肿瘤微环境下的细胞通讯进行预测。本发明所述方法能够提高细胞通讯的预测效果，可以应用于人类肿瘤组织中的细胞通讯预测，解决现有方法中基于配体‑受体相互作用预测细胞通讯强度准确率不高的问题。
基于 boosting 深度森林单细胞序数细胞通讯预测方法应用

[发明专利]基于相互作用能项和机器学习的蛋白-配体亲和力预测方法-CN201810735055.5有效
发明人：季长鸽;王卫军;张增辉;闫玉娜;段观福;单金文 -专利权人：华东师范大学
申请日： 2018-07-06 - 公布日： 2021-08-20 - 主分类号： G16H70/40 文献下载
摘要：本发明涉及一种基于相互作用能项和机器学习的蛋白‑配体亲和力预测方法，该方法通过分散配体与蛋白口袋的各种相互作用能项到20种氨基酸残基的主侧链上，并用机器学习的方法对PDB库中已知活性的蛋白‑配体相互作用能信息进行训练得到模型，利用所得模型进行配体与蛋白亲和力打分。本发明通过分散相互作用能项，可以充分考虑不同氨基酸残基主侧链对亲和力的影响；利用机器学习进行非线性拟合，有利于处理各个相互作用能之间的关联或耦合作用，从而针对性的减少不同氨基酸结构在亲和力计算过程中带来的误差
基于相互作用机器学习蛋白亲和力预测方法

[发明专利]相互作用预测装置、相互作用预测方法和程序-CN201380030089.X有效
发明人：北野宏明;辛坤镒;S·高希 -专利权人：学校法人冲绳科学技术大学院大学学园;系统生物学研究院
申请日： 2013-06-13 - 公布日： 2016-04-27 - 主分类号： C12M1/34 文献下载
摘要：本发明取得化合物结构信息，取得与化合物相互作用的候选蛋白质的候选蛋白质结构信息，使用对接模拟方法来计算候选蛋白质与化合物的结合强度，进行结合强度的综合评价，由此确定出作为预测的结合强度的预测结合强度，确定出作为被预测为与化合物相互作用的候选蛋白质的预测蛋白质，使用结合强度模拟方法来计算相互作用强度，进行相互作用强度的综合评价，由此，确定出作为预测的相互作用强度的预测相互作用强度。
相互作用预测装置方法程序

[发明专利]一种高量子产率的稀土金属有机框架材料及其制备方法-CN201810554681.4有效
发明人：凌博恺;李阳;王晓玮;栾天罡 -专利权人：中山大学
申请日： 2018-06-01 - 公布日： 2021-04-02 - 主分类号： C08G83/00 文献下载
摘要：该稀土金属有机框架材料以脱质子的2,4,6‑三(4‑羧基苯基)‑1,3,5‑三嗪为配体，以稀土金属离子为发光中心，通过配体间的π‑π相互作用，或还通过配体与溶剂的C‑H‑π相互作用构建而成。配体间π‑π相互作用对应芳香环中心之间的距离在以内，增强了配体分子间相互作用力，增加了材料骨架的刚性，减少了能量在骨架上的自身损耗，同时也增强了配体到稀土金属的能量传递
一种量子稀土金属有机框架材料及其制备方法

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