本发明提出了与萝卜肉质根色泽相关的基因与萝卜鉴别方法,属于基因工程技术领域,包括无花青素类型萝卜White的RsDFR基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;绿皮紫肉类型萝卜XLM的RsDFR基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;红皮白肉类型萝卜MSH的RsDFR基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;红皮红肉类型萝卜Txh的RsDFR基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO.4本发明发现RsDFR基因是导致萝卜肉质根不同色泽差异的关键候选基因,并将其应用于萝卜鉴别中,可靠性和准确度高。