本发明提出了一种构建芜菁初级核心种质的多态性SSR引物及方法，所述多态性SSR引物包含31对引物，所述引物的序列为SEQ ID No.1～SEQ ID No.62。本发明利用31对多态性SSR引物，对芜菁材料进行扩增，确定遗传相似系数矩阵，将遗传相似系数矩阵通过NTSYS 2.10e及PowerMarker V3.25软件进行聚类分析；采用欧式距离计算聚类分析的原始种质群体的遗传距离，选取芜菁材料的初级核心种质。本发明的芜菁初级核心种质的构建能够排除遗传冗余，使得累积贡献率明显提高。
本发明公开了一种微卫星遗传标记监测曼氏无针乌贼种质的方法，包括DNA的提取，DNA的检测，引物的设计，PCR扩增，种质监测。有益效果为：本发明所选用的微卫星序列SEQ ID No:1‑19等位基因数目多，多态性高，弥补了当前曼氏无针乌贼种质监测中遗传背景模糊、分子标记数量少的局限；种质监测过程能够科学地评价一个种群中基因的多样性、基因库的丰富程度以及各群体在多个基因位点上的遗传变异程度，使种质监测过程更加准确客观。
所述引物组共由22对引物组成，这22对引物的序列如SEQ ID NO:1‑44所示，本发明还提供了所述SSR分子标记引物组在黄连遗传多样性分析和种质资源遗传系谱分析中的应用，所述引物组能有效对不同基源的黄连、不同生境条件下的野生及栽培黄连种质资源进行遗传多样性分析及群体聚类分析。这22对引物具有多态性丰富、扩增稳定、重复性好等优点，是首次基于黄连全基因组开发的SSR分子标记并进行群体遗传多样性分析，本发明为进行黄连种质资源遗传多样性保护、亲缘关系研究、核心种质库筛选奠定了基础。
