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[发明专利]一种真核生物蛋白质的亚细胞定位方法-CN200310123333.5无效
发明人：崔庆华;蒋田仔 -专利权人：中国科学院自动化研究所
申请日： 2003-12-17 - 公布日： 2005-06-22 - 主分类号： C12Q1/04 文献下载
摘要：本发明涉及生物信息学技术领域的一种真核生物蛋白质的亚细胞定位方法。包括两部分：1.最优分类器的获得。2.新的蛋白质序列亚细胞位置的预测。亚细胞位置分为八种，允许用户输入未知亚细胞位置的蛋白质氨基酸残基序列，输出为本系统预测出来的该序列的亚细胞位置。本发明首先针对给定的训练数据集对分类器进行训练，然后通过交叉实验确定出分类器的最优参数，最后得到针对亚细胞定位问题的最优分类器，这时就可以对未知亚细胞位置的蛋白质序列进行亚细胞定位了。本发明可以快速实现蛋白质序列的亚细胞定位，定位准确度比较高，同时也可以实现大批量蛋白质序列的亚细胞定位。
一种生物蛋白质细胞定位方法

[发明专利]蛋白质亚细胞定位的空间蛋白质组学深度学习预测方法-CN202210757754.6有效
发明人：郭雪江;李妍;司徒成昊;王兵 -专利权人：南京医科大学
申请日： 2022-06-30 - 公布日： 2023-06-30 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种蛋白质亚细胞定位的空间蛋白质组学深度学习预测方法，该方法包括：基于蛋白质亚细胞分离组分定量的空间蛋白质组质谱数据，使用差分矩阵捕获每个蛋白质在不同亚细胞分离组分中的变化轨迹来构建特征图谱；利用卷积神经网络的提取蛋白质特征图谱的深度图特征；利用卷积注意力机制模块对深度图特征进行自适应特征优化；进而使用深度神经网络来预测蛋白质亚细胞定位；使用已知亚细胞定位的蛋白质作为训练集进行五折交叉验证，对未知亚细胞定位的蛋白质进行预测；控制蛋白质亚细胞定位的错误发现率，获得高可信度的蛋白质亚细胞定位预测结果。本发明能高效、准确地实现蛋白质亚细胞定位预测，并促进空间蛋白质组学的未来发展和应用。
蛋白质细胞定位空间深度学习预测方法

[发明专利]一种基于深度学习预测长非编码RNA的亚细胞定位的方法-CN202310266369.6在审
发明人：李重;王凯;胡海龙;王霄一 -专利权人：湖州师范学院
申请日： 2023-03-13 - 公布日： 2023-07-11 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明提供了一种基于深度学习预测长非编码RNA的亚细胞定位的方法，用于解决背景技术中提出的现有的对lncRNA亚细胞定位的预测器在Cytoplasm、Nucleus、Exosome、Ribosome和Cytoso的五种亚细胞定位中，预测准确度不高，在测试集上对每个类别的精度、召回率和F‑measure的检测结果较差的技术问题。本发明公开了一种基于深度学习预测长非编码RNA的亚细胞定位的方法，包括(1)构建一个基准数据集；(2)使用独热编码拼接每个核苷酸的电子‑离子相互作用电位(EIIP)和核苷酸的化学性质(NCP)作为输入特征；提供了一种新的对lncRNA亚细胞定位的预测器，提高了预测准确度。
一种基于深度学习预测编码 rna 细胞定位方法

[发明专利]基于亚细胞定位特异性的关键蛋白质识别方法-CN201410399693.6有效
发明人：王建新;彭小清;李敏;罗军伟;钟坚成 -专利权人：中南大学
申请日： 2014-08-14 - 公布日： 2017-02-01 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于亚细胞定位特异性的关键蛋白质识别方法，包括以下步骤步骤1建立亚细胞定位的蛋白质相互作用子网；步骤2衡量各个蛋白质亚细胞定位相互作用子网的蛋白质关键性得分的可信度；步骤3计算所有蛋白质的关键性综合得分步骤4输出结果对细胞内所有蛋白质按关键性综合得分排序并输出排序结果。该基于亚细胞定位特异性的关键蛋白质识别方法在关键蛋白质的识别方面准确性高、敏感度高。
基于细胞定位特异性关键蛋白质识别方法

[发明专利]优化的柑橘Ccl-eEF1a启动子和CsUAP56小内含子构建的载体和应用-CN202210560183.7有效
发明人：苏华楠;王凯丽;李利娜;钟八莲;黄爱军 -专利权人：赣南师范大学
申请日： 2022-05-23 - 公布日： 2023-08-18 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：CsUAP56小内含子构建的载体和应用；使用优化的Ccl‑eEF1a启动子和CsUAP56内含子，结合柑橘和豇豆密码子优化的mEGFP和tdTomato基因等共12个片段构建了适用于柑橘和豇豆瞬时转化的亚细胞定位载体，所述亚细胞定位载体为pHCi12C，该载体已优化消除了所有Golden Gate克隆常用酶切位点，可将候选基因通过双BsmBI酶切位点定向插入mEGFP基因3’端，且载体具有蓝白斑筛选功能可快速鉴定获得阳性克隆；同时载体内设计了核定位tdTomato内部参照，在进行如转录因子亚细胞定位观察时，相较于普通的亚细胞定位载体而言，可不用额外进行细胞核荧光染色步骤，直接将mEGFP‑目的基因融合蛋白定位结果与核定位tdTomato结果作叠加比较，即可准确快捷地评判候选基因是否定位在细胞核。
优化柑橘 ccl eef1a 启动子 csuap56 内含构建载体应用

[发明专利]面向不平衡数据的lncRNA亚细胞定位预测方法和系统-CN202310230653.8在审
发明人：吴昊;刘海斌;董记华 -专利权人：山东大学
申请日： 2023-03-07 - 公布日： 2023-06-13 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明属于亚细胞定位预测领域，提供了面向不平衡数据的lncRNA亚细胞定位预测方法和系统，为了充分利用lncRNA的序列信息，提取了物理化学模式特征和核酸的分布式表示特征，同时整合了两个基础分类器，包括卷积神经网络和门控递归单元，通过两个模型的自适应加权平均后得到亚细胞的分类结果，基于分类结果进行亚细胞定位，可以提高在不平衡数据集对于亚细胞定位预测的精度。
面向不平衡数据 lncrna 细胞定位预测方法系统

[发明专利]一种利用百合叶片检测亚细胞定位的方法-CN202210475594.6在审
发明人：杨盼盼;明军;徐雷锋 -专利权人：中国农业科学院蔬菜花卉研究所
申请日： 2022-04-29 - 公布日： 2022-08-19 - 主分类号： C12N15/84 文献下载
摘要：本发明公开了一种利用百合叶片检测亚细胞定位的方法，包括以下步骤：构建亚细胞定位载体pCAMBIA2300‑GFP和其重组载体，将亚细胞定位载体pCAMBIA2300‑GFP和其重组载体、辅助质粒P19分别转入三株本发明建立了一种利用百合叶片检测亚细胞定位的方法，具有周期短、成本低、易操作、不受基因型限制等优点，能够快速高效地将外源基因在百合叶片中瞬时表达，为百合基因功能研究提供了重要的技术支撑。
一种利用百合叶片检测细胞定位方法

[发明专利]基于深度图像特征和阈值学习策略的蛋白质亚细胞定位的方法-CN202011148528.5有效
发明人：苏苒;何琳琳 -专利权人：天津大学
申请日： 2020-10-23 - 公布日： 2022-05-13 - 主分类号： G16B15/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于深度图像特征和阈值学习策略的蛋白质亚细胞定位的方法，包括以下步骤：步骤1，数据收集和数据预处理；步骤2，数据增强训练集测试集划分；步骤3，构建基于卷积神经网络的特征提取器；步骤4，利用最小冗余最大相关算法结合后向特征消除进行特征提取；步骤5，构建亚细胞定位分类器；步骤6，性能评价，步骤7，利用单标签亚细胞定位预测器蛋白质免疫组化单标签图像进行预测，利用多标签亚细胞定位预测器对蛋白质免疫组化多标签图像进行预测。本发明引入了阈值学习策略，可以更好的挖掘标签与样本以及标签与标签之间的相关性使得多标签蛋白质亚结构的定位预测性能更好。
基于深度图像特征阈值学习策略蛋白质细胞定位方法

[发明专利]一种生物传感器、核酸分子、表达载体及应用-CN202211457733.9在审
发明人：李春;刘夏;秦磊 -专利权人：清华大学
申请日： 2022-11-21 - 公布日： 2023-03-07 - 主分类号： G01N21/64 文献下载
摘要：本发明第一方面提供一种实时监测酵母亚细胞区室内氧化还原水平的生物传感器，当亚细胞区室为细胞质时，生物传感器包括至少一种第一元件，当亚细胞区室为细胞器时，生物传感器包括至少一种第一元件和至少一种第二元件，第一元件为能够监测氧化还原物质并且能够将监测到的生物信号转换为电信号的生物传感元件，第二元件为能够在亚细胞区室内定位表达的定位蛋白元件。本发明提供的生物传感器能够实现酵母亚细胞区室内氧化还原物质的实时动态监测，有利于分析酵母亚细胞区室的氧化还原水平，为改善酵母胁迫抗逆性、提高生产性能提供基础。
一种生物传感器核酸分子表达载体应用

[发明专利]mRNA亚细胞定位模型训练方法、定位方法及可读存储介质-CN202111138369.5在审
发明人：邹权;李静;杜军平 -专利权人：电子科技大学长三角研究院（衢州）
申请日： 2021-09-27 - 公布日： 2021-12-24 - 主分类号： G06K9/62 文献下载
摘要：本发明提供了一种mRNA亚细胞定位模型的训练方法包括以下步骤：获取mRNA亚细胞位置序列样本集；根据多种特征提取算法对mRNA亚细胞位置序列样本集进行特征提取，利用基分类器分别对特征识别，并对基分类器一层以上集成，再根据特征提取算法和集成分类器，得到目标mRNA亚细胞定位模型。
mrna 细胞定位模型训练方法可读存储介质

[发明专利]基于多尺度深度特征的蛋白质亚细胞定位方法-CN202111153587.6在审
发明人：魏乐义;汪逢生 -专利权人：山东大学
申请日： 2021-09-29 - 公布日： 2022-01-04 - 主分类号： G06T7/73 文献下载
摘要：本发明提供基于多尺度深度特征的蛋白质亚细胞定位方法，属于生物信息处理技术领域，利用训练好的预测模型对获取的蛋白质免疫组织化学图像进行处理，获得最终的蛋白质亚细胞定位结果；其中，提取蛋白质免疫组织化学图像中蛋白质序列的多尺度特征，基于多尺度特征得到不同亚细胞位置的预测概率得分向量，结合多标签分类学习策略对预测概率进行判别，得到最终的蛋白质亚细胞定位结果；其中，训练好的预测模型为使用类别不平衡损失优化训练得到。本发明使用空间分布特征和语义特征进行融合，自动提取了更加全面的多尺度特征，提高了效率；基于类别不平衡损失和多标签学习策略，为不同类别施加权重以及考虑不同亚细胞位置的相关性，提高了预测的精度。
基于尺度深度特征蛋白质细胞定位方法

[发明专利]检测白藜芦醇在靶细胞定位的方法-CN201210165843.8有效
发明人：易龙;糜漫天;陈明亮;金鑫 -专利权人：中国人民解放军第三军医大学
申请日： 2012-05-25 - 公布日： 2012-09-19 - 主分类号： G01N21/64 文献下载
摘要：本发明公开了检测白藜芦醇在靶细胞定位的方法，具体为，利用白藜芦醇的自发荧光特性，首先用白藜芦醇预处理靶细胞；再利用的特异性荧光标记的亚细胞器探针处理靶细胞；最后利用激光共聚焦显微镜观察白藜芦醇自发荧光与亚细胞器探针的荧光在细胞内的重叠情况，以确定白藜芦醇在靶细胞的亚细胞器分布；利用本发明公开的方法可以用于检测白藜芦醇在靶细胞中的分布，具有广泛的应用前景。
检测藜芦靶细胞定位方法

[发明专利]蛋白质亚细胞定位方法、系统、储存介质及计算机设备-CN202011316678.2有效
发明人：钟光正;肖燕珊;刘波 -专利权人：广东工业大学
申请日： 2020-11-19 - 公布日： 2023-05-26 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明提出了一种蛋白质亚细胞定位方法、系统、储存介质及计算机设备，将弹球损失函数引入离群点检测算法中来处理蛋白质亚细胞定位的数据；其抗噪效果好，特别是对边界噪声不敏感；约束数量少，计算复杂度低，运算效率高；能够兼顾子集内最小化，所得到的超球体的球心处于数据密集的区域；因而能够快速处理蛋白质亚细胞定位的数据，并相应得到准确、可靠的预测结果。
蛋白质细胞定位方法系统储存介质计算机设备

[发明专利]一种融合多种序列频率信息识别RNA亚细胞定位方法-CN202110286238.5在审
发明人：郭菲;王浩;唐继军;丁漪杰 -专利权人：天津大学
申请日： 2021-03-17 - 公布日： 2021-09-07 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种融合多种序列频率信息识别RNA亚细胞定位的计算方法，包括如下步骤：步骤(1)：通过RNA亚细胞定位数据库提取mRNAs、lncRNAs、miRNA和ssnoRNAs这四个RNA序列数据集本发明可以充分挖掘序列的频率信息，对各种RNA亚细胞定位建立了多标签基准数据集；解决RNA亚细胞定位的一个多标签多分类问题。
一种融合多种序列频率信息识别 rna 细胞定位方法

[发明专利]基于深度卷积神经网络的蛋白质亚细胞定位方法和装置-CN201810002518.7有效
发明人：刘弘;丛菡菡;陈月辉;韩延彬 -专利权人：山东师范大学
申请日： 2018-01-02 - 公布日： 2020-09-04 - 主分类号： G16B15/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于深度卷积神经网络的蛋白质亚细胞定位方法和装置，该方法包括：接收已知蛋白质亚细胞位置的序列信息，建立并存储基准蛋白质序列数据库；将基准蛋白质序列数据库中蛋白质序列进行特征提取，并将提取的特征数据进行特征融合将融合后的特征数据作为深度卷积神经网络的输入，对深度卷积神经网络进行训练，得到深度卷积神经网络分类器；接收待预测的蛋白质序列，进行特征提取并进行相应的特征融合，输入到训练后的深度卷积神经网络分类器，对其蛋白质亚细胞位置进行预测定位本发解决了目前蛋白质亚细胞定位研究中选择优势特征的难题，同时进一步提高准确度。
基于深度卷积神经网络蛋白质细胞定位方法装置

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