[发明专利]一种病原微生物参考知识库的最大多样性聚类构建方法有效
申请号: | 202110331409.1 | 申请日: | 2021-03-29 |
公开(公告)号: | CN112800245B | 公开(公告)日: | 2021-07-16 |
发明(设计)人: | 李瑞琳;盖伟 | 申请(专利权)人: | 微岩医学科技(北京)有限公司;杭州萧山微岩医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | G06F16/36 | 分类号: | G06F16/36;G06F16/35;G16B30/10;G16B30/20;G06N5/02 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 王欢 |
地址: | 100176 北京市大兴区济技术开*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明涉及生物技术领域,具有涉及一种病原微生物参考知识库的最大多样性聚类构建方法。该构建采用贪心缩放算法,通过特定方法计算冗余基因组的多序列相似性,去除扩展相似度高的序列,可以保证在去除大量冗余信息的同时,最大程度保留微生物基因组的多样性。实验表明,本发明提供的病原微生物知识库的最大多样性聚类方法准确性高、检测效率高且数据冗余率低,尤其适用于大规模的病原微生物全基因组序列。 | ||
搜索关键词: | 一种 病原微生物 参考 知识库 最大 多样性 构建 方法 | ||
【主权项】:
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