[发明专利]应用转录组学筛选全氟辛烷磺酸毒性枢纽基因和关键信号通路的方法有效
申请号: | 202110274920.2 | 申请日: | 2021-03-15 |
公开(公告)号: | CN113053453B | 公开(公告)日: | 2022-01-04 |
发明(设计)人: | 翁瑞;王天润;邱静 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院农业质量标准与检测技术研究所 |
主分类号: | G16B5/00 | 分类号: | G16B5/00;G16B30/00;C12Q1/6869 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了应用转录组学筛选PFOS毒性枢纽基因和关键信号通路的方法。本发明所提供的方法首先设定实验动物的空白对照组和PFOS暴露组并进行处理获得生物样本,提取所得生物样本的RNA,通过高通量测序仪获得生物样本的转录组学数据,将获得的测序数据进行生物信息学分析,包括差异基因GO富集分析、KEGG通路富集分析、蛋白互作网络分析和GSEA分析,最终筛选得到PFOS的毒性枢纽基因和关键信号通路结果。应用本发明所提供的方法,可为鉴定PFOS对动物或人类造成的严重影响和/或PFOS对动物或人类的毒性机制以及开发针对PFOS毒性的相关药物提供帮助。 | ||
搜索关键词: | 应用 转录 筛选 辛烷 毒性 枢纽 基因 关键 信号 通路 方法 | ||
【主权项】:
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