[发明专利]真菌基因组测序数据自动分析方法及系统在审
| 申请号： | 202110271328.7 | 申请日： | 2021-03-12 |
| 公开（公告）号： | CN113035277A | 公开（公告）日： | 2021-06-25 |
| 发明（设计）人： | 刘健;孙嘉良;陈娇 | 申请（专利权）人： | 南开大学 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B30/20;G16B40/00;G16B50/10 |
| 代理公司： | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人： | 闫圣娟 |
| 地址： | 300071 天津*** | 国省代码： | 天津;12 |
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| 摘要： | 本公开提供了一种真菌基因组测序数据自动分析方法及系统，包括：获取真菌基因组测序数据，判断测序数据类型；根据测序数据的类型分别进行相应预处理；将预处理后的测序数据进行组装，得到组装后的contigs；基于基因组序列对比对contigs的相似参考基因组进行初步筛选，获得候选参考基因组；利用MinHash数据结构从候选参考基因组中估算所述contigs的相似参考基因组，实现真菌基因组鉴定；并利用获得的相似参考基因组对所述contigs进行下游分析；实现真菌基因组测序数据的自动分析；所述方案基于序列比对和MinHash数据结构对真菌全基因组进行鉴定，可以在实现对真菌种类进行鉴定的同时，找到与真菌同源性最高的参考基因组，从而便于下游分析。 | ||
| 搜索关键词： | 真菌 基因组 序数 自动 分析 方法 系统 | ||
【主权项】：
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