[发明专利]一种基于特征基因的单细胞自动分类方法和装置有效

专利信息
申请号: 202011567060.3 申请日: 2020-12-25
公开(公告)号: CN112837754B 公开(公告)日: 2022-10-28
发明(设计)人: 黄智豪;周祺;康博熙 申请(专利权)人: 北京百奥智汇科技有限公司
主分类号: G16B40/30 分类号: G16B40/30;G16B40/00;G16B50/10;G16B30/00;G16B45/00
代理公司: 北京品源专利代理有限公司 11332 代理人: 巩克栋
地址: 100089 北京市海*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提供了一种基于特征基因的单细胞自动分类方法和装置,所述方法包括:将单细胞基因表达矩阵进行数据过滤、标准化和选择高变异基因后,进行降维处理和聚类处理,获得一个或多个细胞类群;采用负二项分布,从细胞类群中筛选特征基因集;将筛选的特征基因集与细胞类型数据库进行比对,采用超几何分布对比对结果进行检验统计,完成单细胞类型注释和单细胞自动分类。本发明的基于特征基因的单细胞自动分类方法AngryCell涵盖数据预处理、降维聚类、基于负二项分布的特征基因筛选、基于超几何分布的细胞类型匹配以及下游富集分析以及结果可视化等部分,获得的结果可靠准确、可解释性强。
搜索关键词: 一种 基于 特征 基因 单细胞 自动 分类 方法 装置
【主权项】:
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