[发明专利]一种基于测序和数据分析的肥胖风险预测装置的预测方法有效
| 申请号： | 202010810113.3 | 申请日： | 2020-08-13 |
| 公开（公告）号： | CN112086130B | 公开（公告）日： | 2021-07-27 |
| 发明（设计）人： | 李健;杨广霞;许瑶坤;况迎辉;刘安娜 | 申请（专利权）人： | 东南大学 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16H50/30;G16H50/70;G06K9/62;G06N3/04 |
| 代理公司： | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人： | 梁耀文 |
| 地址： | 211189 江*** | 国省代码： | 江苏;32 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明公开了一种基于测序和数据分析的肥胖风险预测装置及其预测方法，包括以下步骤：对原始SNP样本数据的处理；创建初步模型，包括对肥胖进行分类和对身高体重进行回归性分析；创建位点评分模型，所述位点评分模型包括Logistic Regression模型、SVM模型、Decision Tree模型和Random Forest模型；利用数据库的数据对模型进行优化；对优化模型进行分析；引入集成学习的肥胖预测模型。本发明通过将机器学习和基因分析相结合，利用庞大的基因型与对应个体的生理信息数据库，实现对个体肥胖风险的预测以及生理信息异常风险进行评估。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 数据 分析 肥胖 风险 预测 装置 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于东南大学，未经东南大学许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/202010810113.3/，转载请声明来源钻瓜专利网。
- 同类专利
- 一种基于靶向高通量测序序列的比对方法及其应用-202311109674.0
- 夏涵;官远林;段美林;牛毓龙;魏康飞;杨军波;胡龙;骆晨 - 予果生物科技（北京）有限公司;西咸新区予果微码生物科技有限公司;予果智造科技（北京）有限公司
- 2023-08-30 - 2023-10-27 - G16B30/10
- 本发明公开了一种基于靶向高通量测序序列的比对方法及其应用，该方法包括：构建物种序列数据库，获取带有引物的测序序列，去除测序序列的测序接头，定位引物在测序序列中的位置，将测序序列分类后提取潜在扩增目标序列的测序序列，将潜在扩增目标序列的测序序列比对到物种序列数据库中，确定测序序列的物种来源，将未比对到物种数据库的测序序列进一步比对到人源基因组中，最终将分析结果汇总。对比对区域的序列覆盖度、比对结果的期望值和比对区域的错配碱基数目进行阈值限定，同时满足三种阈值即得到测序序列对应的物种来源。本发明为快速鉴定病原微生物、降低鉴定错误、辅助优化引物设计以及实验流程提供一种测序序列的比对方法。
- 高通量测序配对数据污染判定的方法及装置-202311178383.7
- 于洋 - 北京诺禾致源科技股份有限公司
- 2023-09-13 - 2023-10-24 - G16B30/10
- 本发明公开了一种高通量测序配对数据污染判定的方法及装置。该方法包括：S1，基于肿瘤样本与对照样本的测序数据进行SNV、CNV和LOH突变检测；S2，过滤CNV区域和LOH区域的SNV突变位点，保留非CNV区域且非LOH区域的肿瘤样本与对照样本的共同的SNV突变位点；S3，将S2获得的数据进行切片分析，提取肿瘤样本与对照样本测序数据中突变丰度存在差异的疑似遭遇污染的纯合突变位点；以及S4，通过统计学检测判定S3中提取的疑似遭遇污染的纯合突变位点异常状态。应用本发明避免了由于FFPE样本质量问题导致疑似体系杂合性缺失引起的误判。
- 一种通过相似度进行菌株溯源及属性鉴定的方法-202210991537.3
- 王辉;王舒意;孙世俊;郭一凡;王启;李振中 - 北京大学人民医院
- 2022-08-18 - 2023-10-24 - G16B30/10
- 本发明提供一种通过相似度进行菌株溯源及属性鉴定的方法，其包含如下步骤：a）将样本中菌株的测序序列或组装序列和聚类泛基因组数据库中每个簇的泛基因组进行序列比对；b）根据比对上序列的覆盖度筛选比对结果；c）根据筛选的比对结果计算簇相似度，选取簇相似度最大的L个簇作为候选簇；d）从每个所述候选簇中选取株相似度最大的M个原始菌株作为候选菌株；e）从所述候选菌株中，选取株相似度最大的N个原始菌株，作为来源菌株；f）根据所述来源菌株获取所述样本中菌株的来源信息及属性信息。采用此方法可快速、准确地鉴定出病原微生物的属性和来源。
- 病原体耐药基因检测方法、装置、设备及存储介质-202310880936.7
- 张朋;周金升;宋佳平 - 珠海碳华检测科技有限公司;珠海碳云智能科技有限公司
- 2023-07-17 - 2023-10-20 - G16B30/10
- 本发明公开了一种病原体耐药基因检测方法、装置、设备及存储介质，其中方法包括：将从待测生物样本中提取第一预设平均测序深度下的测序数据与从基因数据库中获取的同源耐药基因序列进行比对，得到多条比对记录以及每条比对记录对应的比对质量值；根据比对质量值过滤掉非最优比对，得到每个基因正确比对记录的条数；基于预设计算方式和正确比对记录的条数计算得到待检测基因的丰度得分，并根据丰度得分统计每个待检测基因的丰度得分排名；将每个待检测基因的丰度得分和丰度得分排名输入至预先训练好的耐药基因检测模型进行预测，确认待检测基因是否为真阳性耐药基因。本发明能够利用基因的丰度得分和丰度得分排名准确预测基因是否为真阳性。
- 基于临床样本的染色质可及性数据分析方法-202010843055.4
- 方靖文;瞿昆;李杨;朱连邦 - 杭州瀚因生命科技有限公司
- 2020-08-20 - 2023-10-20 - G16B30/10
- 本申请涉及一种基于临床样本的染色质可及性数据分析方法，以ATAC‑seq测序数据的研究作为出发点，以临床样本的应用为着眼点，构建了一个整合多种功能的ATAC‑seq测序数据分析流程。该流程既包含对单个临床样本的ATAC‑seq测序数据进行初步分析，也可对多组临床样本的ATAC‑seq测序数据进行全面分析，更包含了临床研究所需的转录因子分析及拷贝数变异分析等。本发明为临床多组间的染色质可及性数据分析，为寻找对应的临床生物标记物，以及针对临床病症用药具有积极作用。
- 流式测序分析方法、装置、存储介质及计算机设备-202310834707.1
- 杨姣博;张优劲;贺增泉;王今安;晋向前 - 深圳华大基因科技服务有限公司
- 2023-07-10 - 2023-10-17 - G16B30/10
- 本申请提供的流式测序分析方法、装置、存储介质及计算机设备，在获取到待分析样本和对应的分析需求以及当前各个测序仪的空闲情况后，由于使用二代测序技术的第一测序仪和使用三代测序技术的第二测序仪的测序优势不同，因此，本申请可以结合待分析样本的样本特性、分析需求以及各个测序仪的空闲情况来确定目标测序仪，该目标测序仪可以是第一测序仪，也可以是第二测序仪，还可以使用第一测序仪与第二测序仪进行混合测序，这样不仅可以为用户提供多样化的使用场景，还可以在一定程度上提升测序效率和测序精度；接着，本申请可以通过目标测序仪对待分析样本进行测序，并得到与待分析样本对应的碱基序列，该碱基序列为二进制序列。
- 一种快速检查基因打靶特异性的方法及系统-202310802061.9
- 陈小玲;黄尚飞 - 广西科学院
- 2023-07-03 - 2023-10-13 - G16B30/10
- 本发明涉及一种快速检查基因打靶特异性的方法及系统，包括以下步骤：接收目标基因组的测序数据；在所述目标基因组的测序数据中查找靶序列，将目标基因组上查找到与靶序列一致的序列标记为靶DNA，并记录靶DNA的数量；计算所述靶DNA的总数；判断所述靶DNA的总数是否为1；当判断所述靶DNA的总数是1且靶DNA与靶序列相同时，输出所述靶序列具有特异性。本发明通过以目标生物的基因组为查找范围，在目标基因组中查找与靶序列、靶序列反向互补序列等相同的序列的总数，如果总数为1且该序列与靶序列相同，认为靶序列具有特异性，当靶序列具有特异性时，目标基因组上没有脱靶位点，用该靶序列引导剪切蛋白剪切目标序列，基因编辑或基因打靶时不脱靶。
- 一种食醋发酵人工菌群构建方法及应用-202111157939.5
- 郑宇;夏梦雷;王敏;赵翠梅;肖云;夏婷;李暄;刘丹彤 - 天津科技大学
- 2021-09-30 - 2023-10-13 - G16B30/10
- 本发明属于食品发酵技术领域，尤其涉及一种食醋发酵人工菌群理性构建方法及应用。本发明所提供的人工菌群构建方法以宏转录组测序技术为基础，首次采用分组聚类分析构建人工菌群，与食醋原位醋酸发酵过程中的活性微生物群落的相似度≥90％，菌群代谢特征≥80％，能实现人工菌群的理性构建。该发明能很好的提高食醋发酵的稳定性，也可作为其他传统发酵食品菌群构建与分析以及为可重复性风味合成技术提供参考，具有较好的科学价值和应用价值。
- 分子标记指纹数据的比对方法、非暂存态存储介质和装置-202011225870.0
- 王凤格;江彬;霍永学;吴昊天;张云龙 - 北京市农林科学院
- 2020-11-05 - 2023-10-13 - G16B30/10
- 本发明涉及生物信息学领域，具体涉及分子标记指纹数据的比对方法、非暂存态存储介质和装置。本发明通过契合分子标记DNA指纹数据特点，先进行位点和基因型分组后再进行统计，构建了一个快速指纹比对方法。这种方法适用于任意标记DNA数据比对业务场景，该算法解决了指纹数据建库和指纹筛查时的快速比对需要，并可结合实际业务需要通过软件程序化实现该方法，其设计思路非常适合计算机的软件编程实现。该方法还可以应用于多线程和分布式指纹比对这类应用程序中，可以非常明显地提升整体计算效率。
- 一种基于逻辑回归建模的样本同源性检测校验方法及系统-202211678658.9
- 朱燕萍;谢剑邦;郑晖;林健;曹野 - 南京普恩瑞生物科技有限公司
- 2022-12-26 - 2023-10-13 - G16B30/10
- 本发明公开了一种基于逻辑回归建模的样本同源性检测校验方法及系统，方法包括：获取两个VCF格式的基因文件；根据预定过滤筛选条件分别对两个基因文件中的SNPs进行过滤筛选，获得过滤筛选后的SNPs；计算两个样本的第一关联参数；计算两个基因文件的转换与颠换比和拟合前一致性指数；计算过滤筛选后的SNPs的突变频率；并基于满足第一条件确定对多个过滤筛选后的SNPs的突变频率进行线性拟合后确定多个计算参数，包括样本间突变稳定系数、拟合后一致性指数、拟合斜率、拟合方程的决定系数R
- DNA数据编解码方法、装置、计算机设备及存储介质-202310847818.6
- 聂子昂;王洋;黄小罗;叶可江;须成忠 - 中国科学院深圳先进技术研究院
- 2023-07-11 - 2023-10-10 - G16B30/10
- 本申请涉及一种DNA数据编解码方法、装置、计算机设备以及存储介质。所述方法包括：使用深度优先搜索算法对生成的基础碱基序列进行筛选，得到符合预设条件的基础碱基序列；从所述筛选后的基础碱基序列中选择第一设定数量的基础碱基序列作为二进制数据编码时使用的基础碱基序列并构建映射表，选择第二设定数量的基础碱基序列作为用于替换禁忌序列的替换序列；根据映射表将待编码的二进制数据编码为DNA链的碱基序列，并利用所述替换序列对所述碱基序列中的禁忌序列进行替换。本申请实施例能够将任意的二进制数据编码为碱基序列，生成的碱基序列中不包含过长同聚物及禁忌序列，且GC含量均衡，能够降低自行折叠产生二级结构的概率。
- 中药材质量检测方法、装置、设备及存储介质-202310740355.3
- 徐科;帖军;孙媛;路松峰;郑禄;李娟;覃俊;周青;陈正杨 - 中南民族大学;湖北中医药大学
- 2023-06-20 - 2023-10-10 - G16B30/10
- 本发明涉及数据分析技术领域，并公开了一种中药材质量检测方法、装置、设备及存储介质，该方法包括：在中药材区块链中对原始中药材数据进行加密，得到加密中药材数据；从中药材区块链中查询待检测中药材对应的加密中药材数据；通过中药材鉴定模型和DNA分子鉴定技术，对待检测中药材对应的加密中药材数据进行分析，并基于分析结果得到待检测中药材的质量检测信息。相比于现有技术的人工检测方法，由于本发明上述方法通过区块链技术对原始中药材数据进行加密，并结合中药材鉴定模型和DNA分子鉴定技术对加密后的中药材数据进行分析，得到待检测中药材的质量检测信息，从而能够快速准确地对中药材进行质量检测。
- 基因检测高通量测序数据的分析方法及系统-202311135427.8
- 杨骁 - 深圳人体密码基因科技有限公司
- 2023-09-05 - 2023-10-10 - G16B30/10
- 本发明涉及生物信息技术领域，公开了一种基因检测高通量测序数据的分析方法及系统，用于提高测序数据分析的准确率。包括：对原始测序数据进行数据清洗，得到待处理测序数据；获取参考基因组序列，对参考基因组序列进行索引参考组序列生成，得到索引参考组序列；通过索引参考组序列对待处理测序数据进行数据比对，得到序列比对结果；基于序列比对结果对待处理测序数据进行序列变异识别，得到变异序列数据；对变异序列数据进行基因型分析，得到目标基因型数据并进行生物学信息分析，得到目标生物学信息；对目标生物学信息以及变异序列数据进行数据融合，生成目标分析报告，对目标分析报告进行加密处理，得到目标加密数据。
- 构建目标蛋白质组谱图库的方法和应用-202310806229.3
- 张珅;雷姣;汪星瑶;林戈 - 中信湘雅生殖与遗传专科医院有限公司
- 2023-07-03 - 2023-10-03 - G16B30/10
- 本申请涉及一种构建目标蛋白质组谱图库的方法和在微量目标蛋白质组分析上的应用，方法包括：通过不同扫描范围对目标蛋白质组进行多次无动态排除的数据依赖采集模式的质谱扫描，以得到目标蛋白质组的质谱数据，目标蛋白质组的质谱数据包括目标蛋白质组多个扫描范围的一级谱，以及每个扫描范围中母离子强度满足预设阈值的二级谱；基于目标蛋白质组的质谱数据进行搜库以构建目标蛋白质组谱图库。本申请通过多个扫描范围无动态排除的数据依赖采集的质谱数据构建谱图库，对微量蛋白质组的DIA数据进行搜库分析，提高了DIA数据匹配的成功率，进而提高DIA数据分析的准确性和灵敏度，提高了微量蛋白鉴定的准确性和灵敏度。
- 一种基于高通量转录组测序的儿童急性白血病分型系统及方法-202310678233.6
- 柳佳琦;陈莉;李金旺 - 上海信诺佰世医学检验有限公司
- 2023-06-08 - 2023-10-03 - G16B30/10
- 本发明公开了一种基于高通量转录组测序的儿童急性白血病分型系统及方法，所述分型系统基于高通量转录组测序数据进行低质量处理后，与参考基因组对应比对获得各基因的序列条数，再基于各个基因上的序列条数以及总测序序列数和基因长度，计算FPKM表达量；最后将FPKM表达矩阵输入随机森林预测模型，得到分型结果。所述分型系统解决了儿童急性白血病患者在进行分子生物学诊断时缺少患者分型信息，进而导致关键变异漏检的问题，为儿童急性白血病分型提供新的方向。
- 一种具有自适应学习控制能力的人类mtDNA快速比对方法及装置-202310708134.8
- 虞秀华;罗皓;虞炯;徐旭辉 - 上海诚明融鑫科技有限公司
- 2023-06-14 - 2023-10-03 - G16B30/10
- 本发明涉及DNA搜索领域，公开了一种具有自适应学习控制能力的人类mtDNA快速比对方法及装置，其中，所述方法包括：将mtDNA划分为多个一级子库，并对所述一级子库进一步划分为二级子库，每入库一个样本，进行自适应排序，形成数据库；所述数据库建立完成后，计算待比对mtDNA的总长度，根据总长度选取所述待比对mtDNA对应的一级子库；计算所述待比对mtDNA与标准序的差异序，同时确认所述待比对mtDNA的基因座值和差异数量总和值，根据所述差异数量总和值选取二级子库；按照自适应排序确定的优先级，将所述待比对mtDNA的基因座值与数据库内mtDNA的基因座值进行比对；本发明的一个方面可以排除大量的无意义比对，自适应控制比对顺序，在较大库容的情况下快速进行人类mtDNA搜索。
- 序列比对方法、序列校正方法及其装置-201910787734.1
- 胡江;韩悦;汪德鹏 - 武汉希望组生物科技有限公司
- 2019-08-23 - 2023-10-03 - G16B30/10
- 本发明提供了一种序列比对方法、序列校正方法及其装置，涉及生物信息技术领域。该序列比对方法主要包括区间比对、碱基比对，配合序列压缩、比对结果优化存储手段，实现了高效、高准确度的比对。该序列校正方法是基于比对结果，通过正序计分、反序回溯，进一步的对低质量区进行校正，实现高效、高准确度的比对。
- 筛选siRNA序列以降低脱靶效应的方法及系统-202310144980.1
- 王全军 - 王全军
- 2023-02-21 - 2023-09-29 - G16B30/10
- 本发明涉及siRNA序列筛选生物信息技术领域，尤其涉及筛选siRNA序列以降低脱靶效应的方法及系统。该方法包括获取siRNA候选序列数据和特征数据，根据特征数据建立机器学习模型，利用训练集对机器学习模型进行训练并得到siRNA序列筛选模型，提取测试集中的数据，输入至siRNA序列筛选模型，即可得到筛选评分，筛选评分最高者，即为最优siRNA。采用该方法及系统不仅筛选效率、精确度、敏感度、特异性和MCC值均显著高于对比例，并且不存在训练多度的情况发生；并且几乎可以免于siRNA对靶mRNA的脱靶效应产生，对将来siRNA干扰效率预测领域有重要参考价值。
- 一种基于高通量测序动植物基因组T2T组装方法-202211549592.3
- 舒自强;蒋冕;樊鹏宇;杨路路;陈刚;苏晓俊;田朝阳;宋驰 - 武汉贝纳科技有限公司
- 2022-12-05 - 2023-09-26 - G16B30/10
- 本发明公开了一种基于高通量测序动植物基因组T2T组装方法，所述方法包括：S1.基于样本测序，分别进行ONT超长测序数据组装及HiFi测序数据组装；S2.基于基因组大小评估结果对两条路线的组装结果去冗余；S3.分别对两条路线组装结果进行HiC挂载，得到染色体级别参考基因组其gap；S4.对ONT线路基因组着丝粒区域进行三代纠错，基于二代数据对ONT线路基因组进行二代纠错；S5.基于原始数据比对末端片段，根据端粒重复基序列的丰度大小进行重组装，再经比对进行末端端粒序列替换，对两条线路的端粒延伸；S6.分别对基因组序列补gap、HiFi纠错；S7.结合已知物种基因组排序对染色体进行调整得到组装后的基因组；所述T2T基因组端粒完整、无空缺，推动了动植物的研究进展。
- 一种细菌及耐药基因整合分析流程及搭建的分析平台-202310414882.5
- 王升启;刘琪琦;陈慧娟;周喆 - 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
- 2023-04-18 - 2023-09-22 - G16B30/10
- 本发明提供一种细菌及耐药基因整合分析流程以及基于该分析流程的搭建的分析平台，所述分析平台为一种不依赖于网络的本地化细菌及耐药基因整合分析平台，包括生物信息分析流程和自动化报告系统两部分，能够同步进行细菌和耐药基因高通量测序数据的分析。本发明所述整合分析平台，同时拟构建可视化的操作界面，以快速、准确且操作简便的实现从原始测序下机数据到报告出具的“数据进，报告出”的自动化一体化分析过程。
- 对具有已知序列的生物序列进行分析的方法和系统-201811290409.6
- 方东明;陈晓丽;吴晨雨;陈利鹏;刘欢;刘心 - 深圳华大生命科学研究院
- 2018-10-31 - 2023-09-22 - G16B30/10
- 本发明提出了一种对具有已知序列的生物序列进行分析的方法。该方法包括：(a)基于所述生物序列，确定所述生物序列的全部Kmer序列，所述生物序列是通过对大片段氨基酸序列或核苷酸序列进行窗口划分获得的；(b)确定所述全部Kmer序列的每一个的频数，并基于所述频数，确定至少一个高频Kmer和至少一个低频Kmer；(c)基于所述至少一个高频Kmer，确定初步重复候选区域，其中，基于所述低频Kmer与相邻高频Kmer之间的距离，确定是否将所述低频Kmer整合至所述初步重复候选区域中。
- 一种罗非鱼基因组选择育种方法-202010008261.3
- 陈松林;卢昇;朱佳杰;孟亮 - 中国水产科学研究院黄海水产研究所
- 2020-01-06 - 2023-09-22 - G16B30/10
- 本发明提供一种基于基因组选择技术培育抗病罗非鱼良种的方法，通过比较GBLUP和BayesCπ在不同标记密度下的预测准确性来选定最适的SNP标记密度；其次，在选定的标记密度下评估其他基因组选择方法的预测准确性。最后综合考虑计算时间和预测准确性，选出适用于罗非鱼抗病育种的基因组估计育种值方法。本发明提供了一种快速、准确估算罗非鱼抗病性状基因组估计育种值的方法，使用该方法获得的子代抗病力高于对照组。通过该方法可加速培育抗病的罗非鱼品种、提高罗非鱼养殖产量、推动罗非鱼养殖产业健康发展。
- 多倍体转录组亚基因组分型方法及计算机可读存储介质-202310605118.6
- 黄子妍;邓操;郝兆楠 - 成都基因汇科技有限公司
- 2023-05-26 - 2023-09-19 - G16B30/10
- 本发明涉及多倍体转录组亚基因组分型方法及计算机可读存储介质，涉及基因组学领域，包括如下步骤：(1)获取参考物种外群基因序列和待测样本转录组序列，将序列翻译成蛋白序列，进行比对，得到比对结果；(2)设定筛选条件，筛选所述比对结果，获得可信度高的比对结果；(3)将可信度大于预设值的所述比对结果进行连接、整合，得到整合结果；(4)设定过滤参数的阈值，筛选所述整合结果，获得大于等于所述阈值的整合结果并将所述阈值的整合结果按照总得分大小逆序排列；(5)保留总得分最高的一条记录。本发明通过将待测样本转录组序列的CDS序列或者转录本序列比对到参考物种外群基因，来对多倍体转录本进行同源基因簇的划分。
- 一种基于从头测序和同源标签图论的抗体序列鉴定方法-202310815532.X
- 张永谦;王旭;李诺敏 - 北京理工大学
- 2023-07-04 - 2023-09-19 - G16B30/10
- 本发明涉及一种基于从头测序和同源标签图论的抗体序列鉴定方法，属于生物分析技术领域。所述方法首先对待鉴定抗体进行切割，得到的肽段溶液进行液相‑质谱分析；然后通过检索确定轻链、重链恒定区肽段序列，并通过从头测序确定可变区候选肽段序列；之后通过发展动态窗口方法结合物种特异性抗体同源库，对从头测序错误进行有效的识别，并能够区分同分异构体形式的亮氨酸与异亮氨酸，提升了组装准确率与组装稳定性。
- miRNA与疾病关联预测方法、设备及存储介质-202310542486.0
- 彭理;涂嫄;梁伟 - 湖南科技大学
- 2023-05-15 - 2023-09-19 - G16B30/10
- 本发明公开了一种miRNA与疾病关联预测方法、设备及存储介质，该方法包括确定miRNA与疾病关联矩阵、miRNA相似性矩阵以及疾病相似性矩阵；构建关于miRNA与疾病关联的异构网络图；计算出miRNA/疾病相似性的拉普拉斯图正则化矩阵；构建图自编码器，其编码器和解码器均采用两层GAT+GCN；将异构关联矩阵、特征空间矩阵、拉普拉斯图正则化矩阵作为图自编码器的输入，得到输出矩阵；根据输出矩阵以及miRNA与疾病关联矩阵计算损失值；根据损失值对图自编码器进行训练，并得到miRNA与疾病的关联预测结果。本发明提升了关联预测的性能。
- 一种基于多重PCR的靶向病原体纳米孔测序快速分析方法-202310725183.2
- 余乐;李寅虎;王志富;武志慧;杨童茜;高军涛 - 佛山源生基因生物科技有限公司
- 2023-06-16 - 2023-09-19 - G16B30/10
- 本发明涉及纳米孔测序技术领域，具体涉及一种基于多重PCR的靶向病原体纳米孔测序快速分析方法，该方法构建了两轮比对分析的病原识别算法，保证了识别的准确性和时效性。首先在第一轮比对中，通过使用两种快速比对软件——vsearch和minimap2，实现了针对典型数据(1Gb纳米孔测序数据)的物种初步判别；在第二轮验证分析中，使用BLAST精确比对算法将第一步判别的各个物种的读段与该物种参考序列进行比对验证，有效减少了精确比对的计算量，将典型数据耗时降低至10分钟内，通过构建该方法，实现了典型纳米孔测序数据在10分钟内的准确分析和报告生成，并可兼容二代测序数据分析。
- 一种基于贝叶斯评价和序列搜库的多肽组学鉴定方法-202210150460.7
- 徐巨才;刘万顺;陈雅君;梁姚顺;严嘉慧;郭素琴;黄峻洪;范丽琪;黄其丽 - 五邑大学
- 2022-02-18 - 2023-09-19 - G16B30/10
- 本发明公开了一种基于贝叶斯评价和序列搜库的多肽组学鉴定方法。该方法包括以下步骤：对样品的质谱检测数据中的各离子进行离子标准化，并进行过滤；针对样品所属的蛋白质序列库中的待检索序列逐一建立待检索多肽序列库，并逐一鉴定待检索多肽序列库中的序列，得到候选鉴定多肽，对候选鉴定多肽进行评分，得到鉴定结果。该多肽组学鉴定方法简单，鉴定效率高，大大降低了分析过程对电脑硬件的要求，有利于实现计算机的多核心并行处理，可同时提供多个候选鉴定多肽供分析者选择，适用于分析食品蛋白质酶解产物、生物医学样本(如血液、体液等)等的多肽组学结果。
- 确定核酸样本中CNV的方法、装置及应用-202010261297.2
- 王泰福;周青;孙井花;王文婧 - 深圳华大生命科学研究院
- 2020-04-03 - 2023-09-19 - G16B30/10
- 本发明涉及基因测序领域，具体涉及一种确定核酸样本中CNV的方法、装置及应用。所提供的方法包括：(1)获取核酸样本的测序数据；(2)基于测序数据，利用CNV检测软件，确定由多个初始CNV构成的初始CNV集合；(3)针对每个初始CNV，确定分类特征；(4)基于每个初始CNV的分类特征，利用预先构建的机器学习模型，对所述初始CNV集合进行筛选，以便获得最终CNV集合，所述分类特征为测序深度、GC含量、CNV类型、长度等多个特征中的至少一种。引入机器学习模型，并基于不同分类特征对初始CNV集合进行筛选，能够很好的排除人工筛选所引入的误差。而且只需要使用单个软件检测即可，最大程度保留了真实的CNV。
- 一种基于贝叶斯模型的编辑基因载体残留检测方法和系统-202310687322.7
- 高强;王志伟 - 北京齐禾生科生物科技有限公司
- 2023-06-12 - 2023-09-19 - G16B30/10
- 本发明请求保护一种基于贝叶斯模型的编辑基因载体残留检测方法和系统，通过全基因组测序数据，依靠数据比对，结合比对质量、同源区域，野生材料降低背景噪音等多种筛选方式，并将最后试验材料剩余的载体测序片段数目与贝叶斯概率模型进行科学融合，推断编辑材料的载体残留情况更为科学有效，充分考虑了重复序列，同源序列，载体中会使用植物同源的启动子。由于实验中会有气溶胶污染，测序中会有测序标签交叉污染等情况，本发明进一步推动基因编辑材料的安全性评价。本发明的技术效果包括利用了大规模高通量的检测手段，综合考虑各种污染情况，更有效地推断编辑材料的载体残留情况，更科学地评价基因编辑材料的安全性。
- 基于数据分析的乳制品生产智能管理平台-202310889208.2
- 张兵;冯宗玲;霍芳;赵蕾;郭璐;马力;唐世云;付石军;莫玲;何斌;魏敏;赵舰;杨建刚;宋义艳;孟庆云;刘吉冰;刘书琪;吴莹;王建猛;王鹏 - 山东省滨州畜牧兽医研究院;山东安又鲜食品有限公司;滨州点石成金技术转移与成果转化服务中心;山东集智生物工程有限公司
- 2023-07-20 - 2023-09-19 - G16B30/10
- 本发明属于乳制品生产管理技术领域，具体涉及基于数据分析的乳制品生产智能管理平台。所述平台包括：样本间隔采样组、环境数据监测系统和数据分析系统；所述样本间隔采样组包括多个相同的采样单元；所述采样单元分别设置于乳制品生产流程中的不同观测节点，对经过该观测节点的乳制品中间产物进行采样，以获得微生物16SrRNA基因序列数据；所述观测节点通过如下步骤进行确定：获取乳制品生产流程中乳制品经过每一个环节后的蛋白质含量、pH值和酸度，基于蛋白质含量、pH值和酸度，确定观测节点，在所述观测节点，蛋白质含量、pH值和和酸度的变化率的和值超过设定的阈值。本发明实现了智能化的生产管理和质量控制。
- 专利分类
- 数据显示系统、数据中继设备、数据中继方法、数据系统、接收设备和数据读取方法
- 数据记录方法、数据记录装置、数据记录媒体、数据重播方法和数据重播装置
- 数据发送方法、数据发送系统、数据发送装置以及数据结构
- 数据显示系统、数据中继设备、数据中继方法及数据系统
- 数据嵌入装置、数据嵌入方法、数据提取装置及数据提取方法
- 数据管理装置、数据编辑装置、数据阅览装置、数据管理方法、数据编辑方法以及数据阅览方法
- 数据发送和数据接收设备、数据发送和数据接收方法
- 数据发送装置、数据接收装置、数据收发系统、数据发送方法、数据接收方法和数据收发方法
- 数据发送方法、数据再现方法、数据发送装置及数据再现装置
- 数据发送方法、数据再现方法、数据发送装置及数据再现装置
