[发明专利]具有聚合酶不可读的编码性寡核苷酸连接的DNA编码文库在审

专利信息
申请号: 201910257744.4 申请日: 2013-07-12
公开(公告)号: CN110257493A 公开(公告)日: 2019-09-20
发明(设计)人: 安东尼·D·基夫;亚历山大·利托夫奇克;马修·A·克拉克 申请(专利权)人: X-化学有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869
代理公司: 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 代理人: 沈敬亭
地址: 美国马*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 发明涉及具有聚合酶不可读的编码性寡核苷酸连接的DNA编码文库。本发明涉及寡核苷酸编码文库的复合物以及使此类文库加标签和使用此类文库的方法。特别是,寡核苷酸和方法可以包括具有至少一个连接的复合物,对于该连接,聚合酶具有降低的通读或移位通过的能力。
搜索关键词: 寡核苷酸 文库 聚合酶 复合物 编码文库 移位 标签
【主权项】:
1.一种确定复合物的核苷酸序列的方法,所述方法包括:(a)提供包括化学连接的所述复合物,其中,所述化学连接是交联寡核苷酸,所述交联寡核苷酸跨越两个相邻标签之间的结点,并且所述交联寡核苷酸经由一个或多个可逆共反应性基团与所述两个相邻标签操作地关联;(b)释放所述交联寡核苷酸以产生模板;(c)可选地通过聚合酶链式反应扩增所述模板以产生扩增的混合物;和(d)测序所述可选扩增的混合物以确定所述复合物的序列,其中所述复合物包括:(i)化学实体,其包括一个或多个支架或者一个或多个结构单元;(ii)第一寡核苷酸标签,其编码所述一个或多个支架或者结构单元中的至少一个的特性;和(iii)帽部分,其具有第一官能团和第二官能团,其中所述第一官能团与所述化学实体操作地关联且所述第二官能团经由第一连接与所述第一寡核苷酸标签操作地关联,对于所述第一连接,聚合酶具有降低的通读或移位通过的能力;或者其中所述复合物包括:(i)化学实体,其包括一个或多个支架或者一个或多个结构单元;(ii)具有n‑1连接的n个数量的寡核苷酸标签,其中n是1和10之间的整数,并且其中每个所述连接是在两个相邻标签之间,并且每个标签编码所述一个或多个支架或者结构单元中的至少一个的特性;和(iii)帽部分,其具有与所述化学实体操作地关联的第一官能团和与所述n个数量的标签中的至少一个经由第一连接操作地关联的第二官能团,其中,聚合酶具有降低的通读或移位通过所述第一连接和n‑1连接中的至少一个的能力。
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  • 王浩华;李昭明;李颖;朱聿铭 - 海南大学
  • 2019-05-24 - 2019-09-10 - C12Q1/6869
  • 本发明属于信号通路控制技术领域,公开了一种基因转录的信号通路控制方法,基于小鼠胚胎干细胞的实验改进机制模型,并分析途径‑途径串扰强度(CTS)对mRNA表达稳定性的影响。本发明根据调节方式调整这种稳定性。此外,有一个最佳的CTS,使表达模式最稳定,但自由能耗最高;CTS可以诱导mRNA水平的随机聚焦,但这是以能量为代价的;在这两种情况下,都存在串扰介导的权衡,这意味着纠缠信号通路可以控制表达稳定性和能量耗散;增强型的串扰信号通路可以在没有额外条件的情况下诱导SF,但需要更多的能量消耗;NESS的潜在景观具有交叉信号传导途径的系统对于理解细胞内过程具有良好的前景。
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