[发明专利]基于峰聚类的单细胞染色质可及性测序数据分析方法和系统在审
申请号: | 201910256667.0 | 申请日: | 2019-03-29 |
公开(公告)号: | CN111755071A | 公开(公告)日: | 2020-10-09 |
发明(设计)人: | 瞿昆;方靖文;黎斌;李杨 | 申请(专利权)人: | 中国科学技术大学 |
主分类号: | G16B20/30 | 分类号: | G16B20/30 |
代理公司: | 中科专利商标代理有限责任公司 11021 | 代理人: | 崔亚松;张莹 |
地址: | 230026 安*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | 一种基于峰聚类的单细胞染色质可及性测序数据分析方法和系统,所述方法包括:将单细胞染色质可及性测序数据与相应的生物样本基因组数据进行比对获得比对结果,并在所述比对结果的基础上寻峰,并计算每个峰内读数,得到细胞*峰的读数矩阵;计算细胞*峰的读数矩阵中峰与峰之间的数学距离,将峰聚类,并将细胞*峰的读数矩阵合并为细胞*accesson的读数矩阵,其中accesson为聚类后的峰。本发明提供了首个从fastq到聚类、可视化和发育路径重塑的scATAC‑seq数据分析方法和系统,并显著提高了分群效果。 | ||
搜索关键词: | 基于 峰聚类 单细胞 染色质 序数 分析 方法 系统 | ||
【主权项】:
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