[发明专利]一种基于不确定图模型侦测蛋白质复合物的方法有效

专利信息
申请号: 201811518891.4 申请日: 2018-12-12
公开(公告)号: CN109493915B 公开(公告)日: 2021-05-07
发明(设计)人: 徐周波;黄文文;刘华东;常亮;杨健 申请(专利权)人: 桂林电子科技大学
主分类号: G16B5/00 分类号: G16B5/00;G16B20/00;G16B45/00
代理公司: 北京中济纬天专利代理有限公司 11429 代理人: 石燕妮
地址: 541004 广西*** 国省代码: 广西;45
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摘要: 发明提出一种基于不确定图模型侦测蛋白质复合物的方法,该方法包括:将蛋白质作为不确定图的顶点,蛋白质之间的相互作用作为不确定图的边;根据不确定图模型,定义期望稠密度,判断每个顶点是否属于核;计算蛋白质和他邻居蛋白质的皮尔逊系数,进一步判断该蛋白质是否属于核;根据不确定图模型,定义邻居顶点相关度,判断该蛋白质是否属于附件;对所有挖掘到的蛋白质复合物进行冗余过滤。本发明所采用的不确定图模型具有很好的表示动态PPI网络,更切合实际,从而加快了搜索效率,更能精确预言蛋白质复合物。
搜索关键词: 一种 基于 不确定 模型 侦测 蛋白质 复合物 方法
【主权项】:
1.一种基于不确定图模型侦测蛋白质复合物的方法,其特征在于,该方法包括:将蛋白质作为不确定图的顶点,蛋白质之间的相互作用作为不确定图的边;根据不确定图模型,定义期望稠密度,判断每个顶点是否属于核;计算蛋白质和他邻居蛋白质的皮尔逊系数,进一步判断该蛋白质是否属于核;根据不确定图模型,定义邻居节点相关度,判断该蛋白质是否属于附件;对所有挖掘到的蛋白质复合物进行冗余过滤。
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