[发明专利]一种用于发现阿尔兹海默症致病关键蛋白质的方法有效

专利信息
申请号: 201810454364.5 申请日: 2018-05-14
公开(公告)号: CN108629159B 公开(公告)日: 2021-11-26
发明(设计)人: 唐毅;王凤珍;刘明宇;吴金华;张雷 申请(专利权)人: 辽宁大学
主分类号: G16B50/00 分类号: G16B50/00;G16B40/00;G16B35/00
代理公司: 沈阳杰克知识产权代理有限公司 21207 代理人: 郑贤明
地址: 110000 辽宁*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要: 一种用于发现阿尔兹海默症致病关键蛋白质的方法,其步骤为:1)、收集阿尔兹海默症文献信息,建立文献数据库;2)、建立蛋白质词典;3)、从文献数据库中提取蛋白质的信息,建立蛋白质矩阵;4)、基于蛋白质矩阵,剔除在网络结构分中与其他蛋白质关联性较小于的蛋白质,得到矩阵中的蛋白质网络特征;5)、根据蛋白质网络特征,计算得到蛋白质社群结构;6)、在蛋白质社群结构中,算得到蛋白质相似性;7)、基于蛋白质相似性的结果,挖掘关键蛋白质。本发明通过上述方法,提供了一种研究效率高,节约生物实验成本的阿尔兹海默症致病关键蛋白质的发现方法。
搜索关键词: 一种 用于 发现 阿尔兹海默症 致病 关键 蛋白质 方法
【主权项】:
1.一种用于发现阿尔兹海默症致病关键蛋白质的方法,其特征在于,其步骤为:1)、收集阿尔兹海默症文献信息,建立文献数据库;2)、建立蛋白质词典,具体包括有蛋白质名称,分类信息,及相互引用关系;3)、从步骤1)中的文献数据库中提取蛋白质的信息,建立蛋白质矩阵,并以步骤2)中的蛋白质词典作为蛋白质矩阵的依据和标准;4)、基于蛋白质矩阵,剔除在网络结构分中与其他蛋白质关联性较小于的蛋白质,计算得到矩阵中的蛋白质网络特征;5)、根据蛋白质网络特征,以矩阵内蛋白质之间相互作用距离作为依据,计算得到蛋白质社群结构;6)、在蛋白质社群结构中,依据节点相似性进行计算,得到蛋白质相似性;7)、基于蛋白质相似性的结果,挖掘关键蛋白质。
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