[发明专利]一种用于发现阿尔兹海默症致病关键蛋白质的方法有效
申请号: | 201810454364.5 | 申请日: | 2018-05-14 |
公开(公告)号: | CN108629159B | 公开(公告)日: | 2021-11-26 |
发明(设计)人: | 唐毅;王凤珍;刘明宇;吴金华;张雷 | 申请(专利权)人: | 辽宁大学 |
主分类号: | G16B50/00 | 分类号: | G16B50/00;G16B40/00;G16B35/00 |
代理公司: | 沈阳杰克知识产权代理有限公司 21207 | 代理人: | 郑贤明 |
地址: | 110000 辽宁*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | 一种用于发现阿尔兹海默症致病关键蛋白质的方法,其步骤为:1)、收集阿尔兹海默症文献信息,建立文献数据库;2)、建立蛋白质词典;3)、从文献数据库中提取蛋白质的信息,建立蛋白质矩阵;4)、基于蛋白质矩阵,剔除在网络结构分中与其他蛋白质关联性较小于的蛋白质,得到矩阵中的蛋白质网络特征;5)、根据蛋白质网络特征,计算得到蛋白质社群结构;6)、在蛋白质社群结构中,算得到蛋白质相似性;7)、基于蛋白质相似性的结果,挖掘关键蛋白质。本发明通过上述方法,提供了一种研究效率高,节约生物实验成本的阿尔兹海默症致病关键蛋白质的发现方法。 | ||
搜索关键词: | 一种 用于 发现 阿尔兹海默症 致病 关键 蛋白质 方法 | ||
【主权项】:
1.一种用于发现阿尔兹海默症致病关键蛋白质的方法,其特征在于,其步骤为:1)、收集阿尔兹海默症文献信息,建立文献数据库;2)、建立蛋白质词典,具体包括有蛋白质名称,分类信息,及相互引用关系;3)、从步骤1)中的文献数据库中提取蛋白质的信息,建立蛋白质矩阵,并以步骤2)中的蛋白质词典作为蛋白质矩阵的依据和标准;4)、基于蛋白质矩阵,剔除在网络结构分中与其他蛋白质关联性较小于的蛋白质,计算得到矩阵中的蛋白质网络特征;5)、根据蛋白质网络特征,以矩阵内蛋白质之间相互作用距离作为依据,计算得到蛋白质社群结构;6)、在蛋白质社群结构中,依据节点相似性进行计算,得到蛋白质相似性;7)、基于蛋白质相似性的结果,挖掘关键蛋白质。
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