[发明专利]用于鉴定单体型的装置和方法

摘要

本发明涉及一种用于基于参考核苷酸序列鉴定多个样本核苷酸序列中的单体型的装置(400)。装置(400)包括处理单元(401)，处理单元(401)用于：通过基于所述参考核苷酸序列从多个样本核苷酸序列中提取多个等位基因序列来产生初始等位基因序列组，其中所述多个等位基因序列中的每个等位基因序列中的每个等位基因与所述参考核苷酸序列中的核苷酸位点相关联；通过将来自所述初始等位基因序列组的在重叠序列部分具有相同等位基因并且属于相同单体型的那些等位基因序列组组合成聚合等位基因序列，基于所述初始等位基因序列组产生第一聚合等位基因序列组，其中第一聚合等位基因序列组包含所述聚合等位基因序列和来自所述初始等位基因序列组的未组合成聚合等位基因序列的等位基因序列；通过连接来自第一聚合等位基因序列组的相邻等位基因序列对，基于第一聚合等位基因序列组产生第二聚合等位基因序列组，其中相邻等位基因序列包含相邻核苷酸位点中的等位基因，但没有重叠等位基因；基于第二聚合等位基因序列组鉴定所述多个样本核苷酸序列中的单体型。