[发明专利]一种基于多维关联特征的E3泛素连接酶-底物相互作用识别方法有效
| 申请号： | 201711305220.5 | 申请日： | 2017-12-11 |
| 公开（公告）号： | CN110021343B | 公开（公告）日： | 2023-05-12 |
| 发明（设计）人： | 陈迪;朴海龙 | 申请（专利权）人： | 中国科学院大连化学物理研究所 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00 |
| 代理公司： | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 | 代理人： | 马驰 |
| 地址： | 116023 *** | 国省代码： | 辽宁;21 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于多维关联特征的E3泛素连接酶‑底物相互作用识别方法，该方法包括如下步骤：S1、获取多维关联特征计算所需的基础数据，收集E3泛素连接酶‑底物相互作用集合及三类不同的对照集合；S2、基于组学数据、蛋白质相互作用网络、通路多个方面计算两个蛋白质间的多维度关联特征；S3、基于所述多维关联特征对比E3泛素连接酶‑底物相互作用与三类对照样本并构建三个随机森林分类器；S4、对三个分类器进行集成，构建E3泛素连接酶‑底物相互作用识别模型。本发明能够用于E3泛素连接酶和底物间的关联特征描述，特别有益于对底物未知的E3泛素链接酶的潜在底物进行预估。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 多维 关联 特征 e3 连接酶 相互作用 识别 方法 | ||
【主权项】：
1.一种基于多维关联特征的E3泛素连接酶‑底物相互作用识别方法包括：S1：获取多维关联·特征计算所需的基础数据，收集E3泛素连接酶‑底物相互作用集合及三类不同的对照集合；S2：基于组学数据、蛋白质相互作用网络、通路多个方面计算两个蛋白质间的多维度关联特征；S3：基于所述多维关联特征对比E3泛素连接酶‑底物相互作用与三类对照样本并构建三个随机森林分类器；S4：对三个分类器进行集成，构建E3泛素连接酶‑底物相互作用识别模型，用于对E3泛素连接酶底物的预测。
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