[发明专利]基于串联质谱与分子对接的活性多肽高通量筛选方法

摘要

本发明涉及医药领域，公开了一种基于串联质谱和分子对接联用的活性多肽高通量筛选方法，本发明采用现代生化技术手段，从海洋软体类、鱼类等动物体内提取制备混合多肽，经过初步活性分离确定活性部位/成分群，采用LC‑MS/MS方法鉴定活性部位/成分群中全部多肽的氨基酸序列，在分子对接软件中，将全部的多肽序列进行同源模建，而后导入分子对接软件与靶蛋白进行对接，分析多肽与靶蛋白的结合率，以评价其抑制/激动的活性，筛选确定的活性多肽通过固相合成结合体外活性评价，验证筛选的准确性。本发明具有快速、高效寻找海洋活性多肽的优点，可操作性强，具有重要的应用价值。

主权项

基于串联质谱与分子对接的活性多肽高通量筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)首先对海洋蛤类进行提取或生物酶酶解，然后分离制备得到总多肽提取物，然后在活性导向下进行活性筛选，确定活性部位；(2)然后通过LC‑MS/MS对活性部位进行质谱分析，将得到的质谱数据通过从头测序分析和/或与蛋白质数据库比对，快速确定蛋白质或多肽的氨基酸序列；(3)然后通过计算机虚拟筛选，将药物作用靶点与活性物质进行分子对接，从而寻找受体与配体作用的最佳构象，筛选出与受体亲和力最佳的配体，完成高通量多肽的活性筛选，并通过固相合成多肽序列验证其活性。