[发明专利]一种在PPI网络中基于遗传算法识别关键蛋白质的方法有效
| 申请号： | 201710144806.1 | 申请日： | 2017-03-06 |
| 公开（公告）号： | CN107092812B | 公开（公告）日： | 2020-06-23 |
| 发明（设计）人： | 刘维;吴蔷梅;陈昕 | 申请（专利权）人： | 扬州大学 |
| 主分类号： | G16B10/00 | 分类号： | G16B10/00;G16B20/00;G06N3/12 |
| 代理公司： | 南京中新达专利代理有限公司 32226 | 代理人： | 孙鸥;朱杰 |
| 地址： | 225009 *** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种在PPI网络中基于遗传算法识别关键蛋白质的算法。本发明在蛋白质相互作用网络中产生初始种群，对个体的适应度计算，赌轮的方法选择操作，在随机挑选的个体对之间进行交叉操作，变异操作，对多个个体解进行局部优化。本发明克服了已有的方法各自存在的缺陷。本发明对该指标进行优化，融合了生物信息，可靠性更高，减少了许多不必要的计算，而且能够对预测出来的关键蛋白质进行局部优化，提高在关键蛋白质识别方面的效率，扩展了该技术在生物信息领域的应用范围和实用性。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 ppi 网络 基于 遗传 算法 识别 关键 蛋白质 方法 | ||
【主权项】：
一种在PPI网络中基于遗传算法识别关键蛋白质的方法，其特征在于，包括如下步骤：(1)在蛋白质相互作用网络中产生初始种群；(2)对个体的适应度计算：对种群中的个体，通过适应度函数计算其适应度值；(3)选择操作：对种群中的个体，按其适应度值采用赌轮的方法选择其参加下一代的种群；(4)交叉操作：交叉操作是按一定概率在随机挑选的个体对之间进行；(5)变异操作：变异操作是按一定的概率在随机挑选的个体上进行的，在进行变异时，随机挑选新个体中的d个蛋白质，将替换成随机挑选的其他蛋白质；(6)局部优化：对多个个体解进行局部优化。
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