[发明专利]一种基于可视化网络的二阶代谢质谱化合物检测方法

摘要

本发明公开了一种基于可视化网络的二阶代谢质谱化合物检测方法，其中，所述方法以现有的二阶代谢质谱数据库为基础，通过对每个化合物二阶质谱数据进行构建可视化网络操作，将其网络全局特征提取为其各自的化合物的输入特征，并通过SVM对其进行训练，获得化合物检测模型，并且通过构建Decoy测试集对检测模型进行交叉验证，保证检测模型的可靠性与准确性，使其可用于实际二阶代谢质谱化合物的检测。本发明提供的二阶代谢质谱化合物检测方法实现简单、并且显著提高了化合物的检测速度与精度。

主权项

1.一种基于可视化网络的二阶代谢质谱化合物检测方法，其特征在于，包括步骤：A、查询并整合二阶代谢质谱数据库，获得训练样本数据集S；B、对所述训练样本数据集S中的每个样本的质谱强度进行归一化处理，获得新的样本数据集T；C、对所述新的样本数据集T中的每个样本进行可视化操作，构建可视化网络，得到可视化网络数据集G；D、从所述可视化网络数据集G中的每一可视化网络中提取网络全局特征，获得可视化网络数据集G的特征向量集F；E、将所述特征向量集F作为SVM的输入，对应的化合物名称作为SVM的输出，对所述新的样本数据集T进行训练，获得检测模型P，用于对二阶代谢质谱化合物进行检测；所述步骤B具体包括：B1、对所述训练样本数据集S中的每个样本的质谱强度进行归一化处理，使每个样本的质谱强度归一化到0～1000；B2、对每个样本的所有谱线进行检测，当检测到谱线的强度低于50时，则删除所述谱线，从而获得新的样本数据集T＝{T1,T2,…,TN}。