[发明专利]谱图相似度的计算方法有效
申请号: | 201610905235.4 | 申请日: | 2016-10-17 |
公开(公告)号: | CN106650779B | 公开(公告)日: | 2019-10-25 |
发明(设计)人: | 乔振刚 | 申请(专利权)人: | 浙江和谱生物科技有限公司 |
主分类号: | G06K9/62 | 分类号: | G06K9/62;G06F16/901;G06F16/903 |
代理公司: | 杭州裕阳联合专利代理有限公司 33289 | 代理人: | 姚宇吉 |
地址: | 310000 浙江省杭州*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明提供一种谱图相似度的计算方法,可以综合评价样品谱图与标准谱图相似度的方法,既能反映待评价样品谱图与标准谱图之间共峰的相似性,也考虑了非共峰数目及其大小对相似度评价的影响,能整体反映谱图之间的相似程度,该相似度的大小能够灵敏地表达样品谱图与标准谱图的定性和定量差异,可靠地鉴定待评价样品。 | ||
搜索关键词: | 相似 计算方法 | ||
【主权项】:
1.一种谱图相似度的计算方法,其特征在于,所述方法如下:所述计算方法提供基于欧式距离公式的谱图相似性打分的方法;(1)针对实验谱图的原始数据计算出每个峰的半峰宽,记为fwhmi,在与参考谱图进行比对时,将在实验谱图的峰的半峰宽范围内出现的参考谱图的峰作为共峰;引入
表示实验谱图i和参考谱图j取l=lij个共峰后实验谱图i中共峰对应的峰值的质荷比构成的向量,
表示实验谱图i和参考谱图j,取l=lij个共峰后由实验谱图i中共峰的峰值强度构成的向量;(2)从下列两种基于欧式距离的公式中任选一种评价实验谱图与参考谱图的相似度:(a)相对欧氏距离法,实验谱图i与参考谱图j的一对共峰之间的欧式距离定义为它们的峰值质荷比差值和峰值强度差值的平方和的平方根,
对该距离进行相对化处理,相对化处理要求以所述一对共峰的最大可能欧式距离为除数,所述最大可能欧式距离为:
因此,在共峰处的相对欧式距离可以表示为
对没有匹配为共峰的峰引入罚分机制,暨假设所述没有匹配为共峰的峰存在一个相对欧式距离为1的共峰,引入罚分后的谱图的相对欧式距离打分公式经过适当变换调整为
式中,ni为实验谱图i中的峰个数,nj为参考谱图j中的峰个数,Eu为两张谱图相似性得分,其分值在0到1之间,分值越高则谱图相似性越高;(b)强度加权相对欧式距离法;通过求实验谱图i和参考谱图j的共峰的强度加权相对欧式距离,并且引入对未匹配为共峰的峰的惩罚分数实现,该公式中的权重系数为第k组共峰的峰强和占所有峰强度和的比例;公式为
式中,iEu视为两张谱图相似性得分,其分值在0到1之间,分值越高则谱图相似性越高。
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