[发明专利]用于分子结构的输入集合的相互作用参数有效
申请号: | 201580074108.8 | 申请日: | 2015-11-24 |
公开(公告)号: | CN107209813B | 公开(公告)日: | 2020-12-22 |
发明(设计)人: | G·切列莫维斯基;P·波波维;G·杰列维扬科;S·格鲁迪迪恩 | 申请(专利权)人: | 国家信息及自动化研究院;国家科研中心 |
主分类号: | G16B15/00 | 分类号: | G16B15/00;G16C20/50 |
代理公司: | 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 | 代理人: | 李晓芳 |
地址: | 法国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | 本发明涉及一种用于对受体‑配体复合物的界面的几何结构进行建模的方法、一种用于对受体‑配体复合物中受体和配体之间的相互作用进行建模的方法、一种用于确定评分向量w的方法(其中评分向量w是量化/限定受体‑配体复合物的界面的几何结构的相互作用的数学向量)、一种用于确定一个或多个受体‑配体复合物中配体相对于受体的位置的结合亲和力或结合自由能的方法、以及一种用于对一个或多个受体‑配体复合物中配体相对于受体的空间位置的结合亲和力或结合自由能进行排序的方法。 | ||
搜索关键词: | 用于 分子结构 输入 集合 相互作用 参数 | ||
【主权项】:
一种用于确定评分向量w的方法,所述评分向量w是量化和/或限定受体‑配体复合物的界面的几何结构的相互作用的数学向量,其中受体‑配体复合物在相互作用中呈现界面,其中所述相互作用需要量化和/或限定,其中所述方法包括以下步骤,其中以下步骤中的至少一个步骤由计算机实现或辅助:(a)从至少一个计算机数据库提供受体和配体的集合;(b)向受体‑配体复合物的界面的每个几何结构指派特定结构向量x,所述特定结构向量x是表示界面的特定几何结构的数学向量;(c)计算作为所有特定结构向量x和评分向量w的函数的线性凸评分函数F;(e)在正交多项式子空间中投影所述评分函数F;(f)用公式表示凸优化问题;(g)求解所述凸优化问题,由此确定评分向量w。
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