[发明专利]山羊SH2B1基因单核苷酸多态性位点及其检测方法

摘要

本发明公开了山羊SH2B1基因单核苷酸多态性位点及其检测方法，以包含SH2B1基因的待测山羊全基因组DNA为模板，以引物对P1、P2为引物，PCR扩增山羊SH2B1基因，然后进行SSCP多态性的检测。其基因多态性位点包括在山羊的SH2B1基因第4356位为T或C的碱基多态性；在山羊的SH2B1基因第6033位为G或A的碱基多态性。本发明把PCR产物混合测序筛查SNP与PCR‑SSCP结合起来解决了SSCP的不稳定性，以防突变位点的漏检，提供了一种用简单、快速、低成本、精确度高的，便于推广应用的在DNA水平上筛查和检测与山羊生长性状密切相关的遗传标记，可用于山羊的辅助选择和分子育种。

主权项

一种检测山羊SH2B1基因单核苷酸多态性位点的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)、以包含SH2B1基因的待测山羊全基因组DNA为模板，以引物对P2为引物，PCR扩增山羊SH2B1基因；所述的引物对P2为：上游引物:5’CCTCCGCTTCAAAGTGCTG 3’下游引物:5’GCGGGAGTTCTGCGAGTC 3’(2)、对步骤(1)的扩增产物进行PCR产物的切胶回收及纯化、测序；(3)、对步骤(2)的纯化产物进行PCR‑SSCP检测：首先对纯化的PCR产物分别用变性剂进行变性处理，然后根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果判定其多态性位点的基因型，所述多态性位点包括：在山羊的SH2B1基因第6033位为G或A的碱基多态性位点，表现为GG，GA两种基因型，所述第6033位为G或A的碱基多态性位点是指扩增产物5’CTCGGCAA 3’序列段中第4位为G或A的碱基多态性位点，基因型GA的体长显著高于纯合基因型GG。