本发明涉及棉花WRKY转录因子及其应用技术领域,具体是一种棉花GhWRKY51转录因子及其编码基因与应用。棉花GhWRKY51转录因子,是如(a)或(b)所示的蛋白:(a)SEQ ID NO.2所示的蛋白质;(b)将SEQ ID NO.2所示的蛋白质通过一个或多个氨基酸的替换、缺失或/和插入而衍生得到的仍具有GhWRKY51转录因子功能或活性的蛋白变体。本发明GhWRKY51在施用JA、ABA、GA 中表达表现为显著上调,施用SA是表达变化不大,利用干旱和NaCl处理时发现GhWRKY51基因表达均显著上调。过量表达的转基因烟草能够产生高的抗逆性。