本发明提供了一种重组猪圆环病毒2型Cap蛋白三聚体及其表达体系和应用,属于猪圆环病毒防治技术领域。本发明提供了一种氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示的重组猪圆环病毒2型Cap蛋白三聚体,克服了现有技术中猪圆环病毒的疫苗免疫原性差、应用有风险等问题。本发明提供的蛋白三聚体免疫原性好,能够有效保护猪免受野毒的攻击,在制备动物疫苗中具有良好前景。采用大肠杆菌表达系统生产,得到的重组蛋白用于制备疫苗不含病原感染性物质,能够避免活病毒疫苗毒力返强、灭活疫苗灭活不完全等的潜在风险。特定的表达系统可高效规模化生产Cap蛋白三聚体疫苗,具备成本低、产量高的优势。